作者：鲁伟，热爱数据，坚信数据技术和代码改变世界。R语言和Python的忠实拥趸，为成为一名未来的数据科学家而奋斗终生。个人公众号：数据科学家养成记 （微信ID：louwill12）第三篇戳：R语言爬虫系列3|HTTP协议无论是R中的RCurl组件还是Python的BeautifulSoup库，对网页HTML完成下载解析之后我们从这些看似杂乱无章的文本中拿到我们感兴趣的数据。之前在系列2的时候小编... 阅 读 全 部 >
作者：Carson 数据分析师，R语言中文社区专栏作者。知乎专栏：https://zhuanlan.zhihu.com/carson-0814数据源：朝阳医院2016年销售数据分析指标：1、月均消费次数；2、月均消费金额；3、客单价；4、消费趋势打开excel数据源，数据的基本字段如下：一、将excel数据源导入R中二、对数据进行预处理“数据是一件麻烦的事——一件非常非常麻烦的事。”，数据分析工作... 阅 读 全 部 >
作者：yhat大约3年前我开始使用R，起初进展很慢，与我习惯的语言相比，语法更加直观也比较简单，而且需要一段时间才能习惯于细微的差别。我还不清楚语言的力量与社区和各种包的密切关系。和其他语言（比如Python和Java）相比，R可以更模糊和麻烦。好消息是，有大量的包可以在R基础库上提供简单和熟悉的界面。这篇文章是我喜欢和每天使用的10个包，并且我希望自己能早些知道他们。...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
先用几个问题检验一下你是否需要看这篇文章dplyr包中如何批量筛选变量做汇总计算，知不知道有summarise_all at 这类函数reshape2包中的融合重铸和分组计算有什么关联tidyr 包的使用Hadley 大神本文介绍数据处理上的其他方面，和上一篇文章合在一起就可以组成处理数据的一个完整的系统。本文目录如下...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
《R语言实践》专栏·第10篇 文| RUser 1671字 |4分钟阅读【R语言】开通了R语言群，大家相互学习和交流，请扫描下方二维码，备注：姓名-R群，我会邀请你入群，一起进步和成长。本文收录一些ggplot2包画图相关的 主题函数，使用这些主题相关函数，可以美化你的图形，让图形的风格更加优雅。幸运的是，已经有很多设计和构建好的主题供我们使用，我们只需要在自己的图形上，选择适合自己主题即可。 这... 阅 读 全 部 >
taoyan：伪码农，R语言爱好者，爱开源。个人博客: https://ytlogos.github.io/library(ggplot2)#使用数据集mtcars演示ggplot(mtcars)+ geom_point(aes(wt, mpg), color="red")+geom_text(aes(wt, mpg, label=rownames(mtcars)))+theme_cl...阅读全... 阅 读 全 部 >
ggplot2 Extension“ggplot2 自从2007年推出以来，成为世界范围内下载最频繁、使用最广泛的R包之一。许多人包括ggplot2的创建人Hadley Wickham将这一成功归功于 ggplot2背后的哲学 。这个软件包的灵感来源于Leland Wilkinson编写的《图形语法》一书，在此书中将 graphs分解成 scales和 layer...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
使用R语言clusterProfiler包进行KEGG富集分析（有参分析）我们在前面的视频教程中，为大家讲述了GO、KEGG富集分析的基本原理，并展示了如何使用DAVID进行GO富集在线分析的过程，详情请添加微信公众号查看“没想到基因GO富集分析这么简单”。本节继续以R语言clusterProfiler包中的方法为例，展示如何进行KEGG富集分析。下文使用的测试数据和R代码等，可添...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
近几十年，系统生物学慢慢走近科研者的视野，主要着眼于研究细胞信号转导、基因调控网络、生物系统组成。多组学联合分析可以由表及里，解析直接原因和根本原因，深入阐释作用机理。在多组学的联合应用中，最终都要落脚到功能注释和通路富集分析，其中基于通路富集分析的图形展示丰富多样，通过此分析可找到与研究相关的通路、关键基因/代谢物，以便进行后续的数据挖掘。进行富集分析的软件有很多，本篇主要安利一下cluster... 阅 读 全 部 >
随着技术的进步和革新，高通量的数据越来越容易，在SCI文章中也越来越重要。不管是转录组学还是蛋白质组学，对分析得到的差异分子进行聚类，最先想到的，必然是GO富集分析。GO富集分析在很多文章中都成为Figure的一部分，一张好看的GO分析图，是可以给数据加分的。在此，小编在此给大家分享最常见的GO分析图的绘制，保证手把手学会哟。壹软件运行准备Prism和excel，小编用的是Prism 8版本，以及... 阅 读 全 部 >