作者：易基因总体来说，DNA甲基化一般遵循三个步骤进行数据挖掘。首先，进行整体全基因组甲基化变化的分析，包括平均甲基化水平变化、甲基化水平分布变化、降维分析、聚类分析、相关性分析等。其次，进行甲基化差异水平分析，筛选具体差异基因，包括DMC/DMR/DMG鉴定、DMC/DMR在基因组元件上的分布、DMC/DMR的TF结合分析、时序甲基化数据的分析策略、DMG的功能分析等。...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
开源 Python 和命令行程序 gget 可以高效、轻松地以编程方式访问存储在各种大型公共基因组参考数据库中的信息。 gget 与可获取用户生成的测序数据的现有工具一起使用 ，以取代在基因组数据分析过程中效率低下、可能容易出错的手动网络查询。虽然 gget 模块的灵感来自于繁琐的单细胞 RNA-seq 数据分析任务），但我们预计它们可用于广泛的生物信息学任务。gget文章...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >
楔子1最终目的 大家好，我是鑫仔。我们将用三期推文，讨论一个大家比较感兴趣问题：影像组学研究的最终目的是什么？构想一：我们希望构建分类器或者预测模型，能够帮助我们辅助诊断、评估疗效、预测预后； （这个时候我们建立的科学假设往往是影像组学特征可以反应xxx患者的结局信息）构想二：我们希望影像组学可以为我们提供一种易于获得、非侵入、低消费、3D的方式获得客观测量和评估的特征（定量），作为正常生物过程、... 阅 读 全 部 >
国家自然科学基金可以帮助研究型临床医生和科学家成长，在成长过程中国自然标书的申请，以及成果的转化，是一个永恒的话题。我们知道，国自然的转化成果类型包括：期刊论文、专利、会议论文、奖励、专著。那么工具病毒是如何助力老师们的国自然成果转化呢？为了便于老师们理解工具病毒的功能与应用场景，我从国自然官网上检索出了腺相关病毒[1]、慢病毒[2]、腺病毒[3]助力，国自然成果转化的期刊论文，进行简要解读...... 阅 读 全 部 >
川芎Ligusticum chuanxiong Hort.是伞形科藁本属草本植物，以干燥的根茎入药，始载于《神农本草经》， 已有1500多年的种植历史，是我国传统的大宗中药材。川芎广泛分布于我国四川彭州、什邡、眉山等地，在云南、贵州、广西、湖北、江西等省也少量引进种植。川芎性温，味辛、微苦，具有活血行气、祛风止痛的功效，其主要化学成分包含挥发油、生物碱、有机酸和多糖等，在临床上广泛地用于治疗心脏病... 阅 读 全 部 >
单细胞测序技术能够精确细分每个细胞独特的基因表达特征，深入研究细胞间的相互作用关系，在肿瘤免疫等方面成为人们越来越看重的技术，热度也是不断上涨。随着热度的增加，关于单细胞的文献数据也是爆炸性增长！大家在学习单细胞技术和写论文时，很多问题也是爆炸性增长！那么如何快速找到需要的单细胞数据？有哪些好用工具可以帮助我们完成日思夜想的论文？今天小编在这里挑选了一些好用且有特色的单细胞数据库分享给大家。1、P... 阅 读 全 部 >
大肠杆菌和金黄色葡萄球菌是引起奶牛乳腺炎的主要病原体，前者可引起强烈的免疫炎症反应而促进自愈，后者则通常缺乏炎症反应。目前对金葡菌抑制免疫反应的机制研究尚且不足。近期，浙江大学动物病理实验室谭勋老师团队在 Cells 期刊发表了题为“大肠杆菌和金葡菌差异调控 Nrf2 通路导致牛乳腺上皮细胞发生不同免疫炎症反应”的文章。研究团队采用转录组学分析后发现，大肠杆菌和金葡菌差异调控 Nrf2 ...阅读... 阅 读 全 部 >
这篇文章主要为大家介绍了Python Django项目和应用的创建，具有一定的参考价值，感兴趣的小伙伴们可以参考一下，希望能够给你带来帮助目录创建一个Django项目settings.py项目配置文件urls.py路由系统总结创建一个Django项目创建一个名为project的Djang...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
这篇文章主要介绍了python之django路由和视图案例教程,本篇文章通过简要的案例,讲解了该项技术的了解与使用,以下就是详细内容,需要的朋友可以参考下django路由和视图要了解django是如何运行的，首先要了解路由和视图两个概念，然后我们在项目中添加一些简单的路由和视图路由和视图的概念视图：一个视图函数（类），简称视图，是一个...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
Django 是一个开放源代码的 Web 应用框架，由 Python 写成，今天通过本文给大家介绍python Django框架快速入门教程，适用后台管理，感兴趣的朋友跟随小编一起看看吧python下有许多款不同的 web 框架。django是重量级选手中最有代表性的一位。许多成功的网站和app都基于django。django 是一个开放源代码的 web 应用框...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >