2023 06-23 干货第一弹!多组学联合分析之代谢组FAQ 代谢组是对生物体内代谢产物全谱分析的一种研究手段,代谢产物包括核酸、蛋白质、脂类生物大分子以及其他小分子物质,目前主要是检测1000Da以下的物质。代谢组研究具有高通量的检测能力、高灵敏度和准确度、非侵入性、非破坏性、全面性、数据资源整合等特点。通过LC-MS/GC-MS评估生物体或细胞产生的代谢产物的水平以及变化,可以进一步研究这些代谢产物与转录组学差异基因或微生物的关系。在这个系统生物学...... 阅 读 全 部 >
2023 06-18 染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)的数据挖掘思路 |干货系列 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。CHIP-seq研究的数据挖掘思路主要分为3步:整体把握CHIP-seq图谱特征:peak/reads在基因组上的分布、peak在元件上的富集、peak在基因元件上的分布、peak的motif分析、peak距离TSS位点的距离分析、peak修饰基因的功能分析筛选具体差异peak和基因:差异peak鉴定、非时序数据的...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2023 06-17 16S从实验到数据分析最全流程 本文主要介绍了16S的实验、建库、数据分析等过程,也是我自己近期的一个小总结,初学之时从很多前辈的无私分享中受益良多,在此也和大家分享一些我的见解,当然我也只是一个初学者,还有很多不完备之处,希望能与各位一起交流分享。导航本文一共分为三个部分:实验部分建库测序16S测序数据分析一. 实验部分:DNA提取与质检1...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023 06-16 文献中这些奇奇怪怪的图看不懂啊 生信分析类研究,可以说是近两年火热的科研话题了。随着大数据时代的来临,「拍脑门」想选题的时代已一去不复返,从「别人的数据中」挖掘出自己所需的研究核心已经是大势所趋。更何况,据传说——做生信分析的人可以「不做实验」、「无需编程」、「坐在电脑前」、「轻松发文章」。哇!想想都能笑出声来……忍不住暗搓搓的摩拳擦掌一番,打开一篇生信文章,一窥其真容,看看能不能从...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >