摘要：在有利的人造环境中培养细胞已成为细胞和分子生物学中的一种多功能工具。培养的原代细胞和连续细胞系在基础、生物医学和转化研究的调查中不可或缺。然而，尽管它们扮演着重要的角色，但细胞系经常被其他细胞、细菌、真菌、酵母、病毒或化学物质污染或误认。此外，处理和操作细胞与特定的生物学和化学危害相关，需要特殊的防护措施，如生物安全柜、封闭容器和其他专门的防护设备，以最小化暴露于有害物质的风险，并保证无菌工... 阅 读 全 部 >
一、历史放在最前头首先，FFT是离散傅立叶变换 (DFT) 的快速算法，那么说到FFT，我们自然要先讲清楚傅立叶变换。先来看看傅立叶变换是从哪里来的？傅立叶是一位法国数学家和物理学家的名字，英语原名是Jean Baptiste Joseph Fourier(1768-1830)，Fourier对热传递很感兴趣，于1807年在法国科学学会上发表了一篇论文，运用正弦曲线来描述温度分布，论文里有...阅... 阅 读 全 部 >
1如何向PRIDE提交数据PRIDE可以直接提交蛋白质和多肽鉴定/定量数据以及随附的质谱证据和任何其他相关数据类型。PRIDE支持任何实验方法得到的蛋白质组学数据集的存储。当前，向PRIDE提交数据的方式是使用“PX Submission tool”（详细操作步骤与附于文末）。2注册成为PRIDE注册用户在提交到PRIDE数据库之前，用户需要确保它具有使用PRIDE资源的帐户。如果您还没有PRID... 阅 读 全 部 >
很多在华盈生物完成质谱检测服务后的客户，到了文章发表的阶段都会咨询如何上传原始数据到公共数据库这个问题。对于组学研究来说，文章发表时杂志社一般会要求将原始数据上传到公共数据库，并在正文中提供相应数据库编号供同行下载，以重新进行数据分析和核对。随着蛋白组学的发展，专门供质谱原始数据储存和分享的数据库也出现了，功能也日趋完善。今天，小编将为大家介绍一款目前应用体验度排名靠前的数据库——Prote...... 阅 读 全 部 >
在当今生物信息学飞速发展的时代，如何快速找到适合自己的分析工具、获取最新的技术资源，成为了每位研究者都关心的问题。今天要向大家介绍的是生物信息学领域的重要资源网站——Bioconductor(https://www.bioconductor.org/)。相信会安装R包的小伙伴一定听说过BiocManager包，之前我们也有提到过：。本次我们详细讲解一下提供BiocManager包的...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
基因序列到进化树：轻松掌握多物种DNA序列比对与进化分析基因序列的多物种比对与进化分析是研究物种间遗传关系和功能保守性等的关键步骤。今天，我们将以T2R41基因为例，手把手教大家如何下载基因序列、进行多序列比对，以及构建分子进化树。1. 搜索基因并下载序列首先，打开NCBI官网[1]，在搜索栏输入目标基因名称T2R41。输入名称进入搜索结果页面后，...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
在上一期文章中，我们介绍了如何在线高效完成蛋白序列比对，并获得了 .fasta 或 .fa 格式的比对结果文件。本期，我们将通过 ESPript 工具，将这些比对结果转换成清晰、美观的图，让研究成果轻松达到出版级别。什么是ESPript？ ESPript (Easy Sequencing in PostScript) 是一个专为学术研究者设计的在线工具，可以将序列比对结果可视化，并结合二级...阅... 阅 读 全 部 >
一文教你快速完成多物种蛋白序列比对及进化树构建！当我们研究一个蛋白时，探索其在不同物种间的保守性很关键。这不仅能帮助我们理解蛋白的功能和进化历史，还能为进一步实验设计提供线索，如保守性等。在本期文章中，我们将教你如何通过Uniprot网站，快速完成多物种蛋白序列比对和进化树构建。无需下载任何工具，全程在线完成，简单高效！步骤一：打开Uniprot并检索目标蛋白打开uniprot网站...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
上期我们一起下载并安装了VMware，您的电脑里已经有了虚拟机，现在我们一起来为虚拟机配置Linux环境。这里我们选择使用Ubuntu桌面版系统。ubuntu系统是一个以桌面应用为主的Linux操作系统，Ubuntu基于Debian发行版和GNOME桌面环境。Ubuntu的目标在于为一般用户提供一个最新的、同时又相当稳定的主要由自由软件构建而成的操作系统，它可免费使用，并带有社团及专业的...阅读... 阅 读 全 部 >
之前说过SNP检测的相关方法，关于SNP的相关的内容可以参考（SNP检测方法 ）。相比于检测方法，可能更关键的是如何确定要检测的SNP位点。那么如何选择跟自己研究相关的SNP位点呢？今天就简单聊一下几种选择SNP位点的方法：1.前期有相关的实验数据的情况前期实验数据包括：家系的全外显子测序数据、相关病例的测序数据等，可以根据前期的测序的数据进行分析(一般由测序公司来完成)。具有家系完整数据的可以根... 阅 读 全 部 >