基因序列到进化树：轻松掌握多物种DNA序列比对与进化分析基因序列的多物种比对与进化分析是研究物种间遗传关系和功能保守性等的关键步骤。今天，我们将以T2R41基因为例，手把手教大家如何下载基因序列、进行多序列比对，以及构建分子进化树。1. 搜索基因并下载序列首先，打开NCBI官网[1]，在搜索栏输入目标基因名称T2R41。输入名称进入搜索结果页面后，...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
在上一期文章中，我们介绍了如何在线高效完成蛋白序列比对，并获得了 .fasta 或 .fa 格式的比对结果文件。本期，我们将通过 ESPript 工具，将这些比对结果转换成清晰、美观的图，让研究成果轻松达到出版级别。什么是ESPript？ ESPript (Easy Sequencing in PostScript) 是一个专为学术研究者设计的在线工具，可以将序列比对结果可视化，并结合二级...阅... 阅 读 全 部 >
一文教你快速完成多物种蛋白序列比对及进化树构建！当我们研究一个蛋白时，探索其在不同物种间的保守性很关键。这不仅能帮助我们理解蛋白的功能和进化历史，还能为进一步实验设计提供线索，如保守性等。在本期文章中，我们将教你如何通过Uniprot网站，快速完成多物种蛋白序列比对和进化树构建。无需下载任何工具，全程在线完成，简单高效！步骤一：打开Uniprot并检索目标蛋白打开uniprot网站...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
上期我们一起下载并安装了VMware，您的电脑里已经有了虚拟机，现在我们一起来为虚拟机配置Linux环境。这里我们选择使用Ubuntu桌面版系统。ubuntu系统是一个以桌面应用为主的Linux操作系统，Ubuntu基于Debian发行版和GNOME桌面环境。Ubuntu的目标在于为一般用户提供一个最新的、同时又相当稳定的主要由自由软件构建而成的操作系统，它可免费使用，并带有社团及专业的...阅读... 阅 读 全 部 >
之前说过SNP检测的相关方法，关于SNP的相关的内容可以参考（SNP检测方法 ）。相比于检测方法，可能更关键的是如何确定要检测的SNP位点。那么如何选择跟自己研究相关的SNP位点呢？今天就简单聊一下几种选择SNP位点的方法：1.前期有相关的实验数据的情况前期实验数据包括：家系的全外显子测序数据、相关病例的测序数据等，可以根据前期的测序的数据进行分析(一般由测序公司来完成)。具有家系完整数据的可以根... 阅 读 全 部 >
单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传变异中最常见的一种，占所有已知多态性的90%以上。SNP研究是人类基因组计划走向应用的重要步骤，这主要是因为SNP将提供一个强有力的工具，用于高危群体的发现、疾病相关基因的鉴定、药物的设计和测试以及生物学的基础研究等。经过近年检测技术... 阅 读 全 部 >
论文想被Scopus上高认可度的著名期刊收录但却无从下手？别担心，今天InVisor芳老师就来和大家聊聊如何才能在scopus期刊上发表论文，详细到连如何搜索+识别你所在研究领域里最好的 Scopus 索引期刊/出版物都会告诉大家。相信了解清楚这些步骤后，大家的论文发表之路会更顺畅。很多论文小白都不清楚Scopus是何物，别担心，芳老师这就为大家做个简单介绍。一、Scopus是什么？...阅读全文... 阅 读 全 部 >
Scopus是Elsevier(爱思唯尔)创立于2004年的摘要和引文数据库，涵盖了丛书、期刊和行业期刊这三种资源类型，截止到2022年12月，Scopus期刊目录中共包含期刊43400本。Scopus与SCIE或SSCI一样，都属于检索工具。Scopus涵盖了世界上最广泛的科技和医学文献的文摘、参考文献及索引。主要收录领域为：医学、农业与生物科学、物理、工程学、社会学、经济、商业与管理、生...... 阅 读 全 部 >
文章选定目标杂志并调整好格式，准备投稿了，不同的杂志投稿系统有着不同的特点吗？在这里主要给大家介绍7种SCI期刊常见的投稿系统界面及各自的特点。1. Editorial Manager代表杂志：LANCETISSN: 0140-6736 IF (2019): 60.392特点：使用该投稿系统的杂志很多，但不同杂志都对应有各自的Editorial Man...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
近些年，单细胞思路是生信研究热点，非肿瘤的单细胞数据相对较少，因此巧妙地运用单细胞数据，是提高文章质量的关键。今天分享一篇非肿瘤相关的纯生信文章，将Single-cell和Bulk RNA数据相结合，用常规的分析方法，发表在Frontiers in Immunology上，一起来看看吧。阿尔兹海默症免疫相关基因的表达和潜在调控机制开始这篇文章之前，我们先回顾一下单细胞RNA测序和Bulk RN..... 阅 读 全 部 >