在做完16S、18S或ITS等微生物多样性研究后，我们常常还会想进一步了解微生物群落的功能。通常情况下，会采用宏基因组、宏转录组或宏代谢组等方法深入分析，但相对于扩增子测序，宏基因组等测序手段的价格还是相对较高，因此需要从已测完的样本中再挑选合适的样本进行宏基因组测序。那么，这个时候就遇到一个问题——我们该如何挑选样本呢？图1.16s+宏基因组关联分析思路1.What——什么是microPITA在... 阅 读 全 部 >
物种分析作为微生物群落研究的核心，决定了文章最终是否能够揭示分组差异的微生物响应/驱动机制。今天，我跟大家分享一篇非常有特色的物种分析案例，文章通过多种高级分析方法，找到了可以指示珊瑚生态系统扰动的微生物。期刊 2019 Microbiome IF=10.465研究背景不论是局部区域还是全球尺度，珊瑚生态系统都面临着前所未有的压力。虽然微生物对珊瑚礁稳定性和功能的重要贡献已被广泛认知，但不同的珊瑚... 阅 读 全 部 >
你可能在想“哦，太棒了，另一种要学习的工具”，但Webmin不一样。这个基于Web的Linux管理工具可以简化Linux管理任务，只剩几次点击、下拉菜单和提示的填空字段，它们可以化解与Apache、Perl和Sendmail等常见应用有关的复杂问题。Webmin使你能够管理Linux系统的软硬件、原生及第三方应用程序、Webmin本身，甚至可以使用面向命令行纯粹主义者的基于Web的文本终端登录进去... 阅 读 全 部 >
每天和分子生物学打交道的小伙伴，想必也经常被引物不特异搞的头晕脑胀，今天小编给大家推荐屡试不爽的引物设计方法，就是用NCBI在线设计，主要步骤如下：1. 打开NCBI官网，在页面最下方找到“Primer-BLAST”，也可以直接点击（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/index.cgi?LINK_LOC=BlastHome）2. 将目的... 阅 读 全 部 >