基因序列到进化树：轻松掌握多物种DNA序列比对与进化分析基因序列的多物种比对与进化分析是研究物种间遗传关系和功能保守性等的关键步骤。今天，我们将以T2R41基因为例，手把手教大家如何下载基因序列、进行多序列比对，以及构建分子进化树。1. 搜索基因并下载序列首先，打开NCBI官网[1]，在搜索栏输入目标基因名称T2R41。输入名称进入搜索结果页面后，...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
在生物信息学研究中，多序列比对是解析生物序列功能和进化关系的重要工具之一。而 MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis) 软件则是进行多序列比对和进化分析的经典工具之一，其强大的功能和可视化界面受到广大科研人员的青睐。本期，我们将手把手教大家如何下载和安装 MEGA 软件，并为接下来的生物信息分析打下基础！MEGA简介MEGA...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
在上一期文章中，我们介绍了如何在线高效完成蛋白序列比对，并获得了 .fasta 或 .fa 格式的比对结果文件。本期，我们将通过 ESPript 工具，将这些比对结果转换成清晰、美观的图，让研究成果轻松达到出版级别。什么是ESPript？ ESPript (Easy Sequencing in PostScript) 是一个专为学术研究者设计的在线工具，可以将序列比对结果可视化，并结合二级...阅... 阅 读 全 部 >
一文教你快速完成多物种蛋白序列比对及进化树构建！当我们研究一个蛋白时，探索其在不同物种间的保守性很关键。这不仅能帮助我们理解蛋白的功能和进化历史，还能为进一步实验设计提供线索，如保守性等。在本期文章中，我们将教你如何通过Uniprot网站，快速完成多物种蛋白序列比对和进化树构建。无需下载任何工具，全程在线完成，简单高效！步骤一：打开Uniprot并检索目标蛋白打开uniprot网站...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
上期我们一起下载并安装了VMware，您的电脑里已经有了虚拟机，现在我们一起来为虚拟机配置Linux环境。这里我们选择使用Ubuntu桌面版系统。ubuntu系统是一个以桌面应用为主的Linux操作系统，Ubuntu基于Debian发行版和GNOME桌面环境。Ubuntu的目标在于为一般用户提供一个最新的、同时又相当稳定的主要由自由软件构建而成的操作系统，它可免费使用，并带有社团及专业的...阅读... 阅 读 全 部 >
之前说过SNP检测的相关方法，关于SNP的相关的内容可以参考（SNP检测方法 ）。相比于检测方法，可能更关键的是如何确定要检测的SNP位点。那么如何选择跟自己研究相关的SNP位点呢？今天就简单聊一下几种选择SNP位点的方法：1.前期有相关的实验数据的情况前期实验数据包括：家系的全外显子测序数据、相关病例的测序数据等，可以根据前期的测序的数据进行分析(一般由测序公司来完成)。具有家系完整数据的可以根... 阅 读 全 部 >
单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传变异中最常见的一种，占所有已知多态性的90%以上。SNP研究是人类基因组计划走向应用的重要步骤，这主要是因为SNP将提供一个强有力的工具，用于高危群体的发现、疾病相关基因的鉴定、药物的设计和测试以及生物学的基础研究等。经过近年检测技术... 阅 读 全 部 >
一、什么是套磁，为什么要套磁？ 套磁是一种以争取录取或者带奖录取为目的的自我展示和推销的手段。通常步骤是首先申请者通过E-mail或者其他方式与目标学校的有关教授联系，通过良好的沟通与问答来增进对彼此的了解，让对方意识到你在简历之外的闪光点，以增加申请者被录取的几率及拿到奖学金的几率。其实，套磁呢，就像男生追女神，能否追到，看实力，看运气，也看颜值。二、套磁的重要性（主要是对博士项目申请...阅读... 阅 读 全 部 >
“套磁”是美国留学申请的一个术语，指的是申请留学的同学们与自己梦校的教授通过Email联系，并通过联系达到增加自己被录取和获得奖学金的机会。当然，“套磁”，也不是对所有的人都有用。通常来说，美国留学中，使用“套磁”申请博士要比申请硕士有用，因为硕士是没有导师带的；申请理工科比文科有用，因为对于理工科的学生而言，所拿到的奖学金，其实就是教授的研究经费的一部分。因此，与其说是学校给你发...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
上期我们介绍了TissueEnrich包的安装方法以及对人鼠的基因列表进行组织特异性基因富集分析，本期我们来学习 TissueEnrich 包如何鉴定组织特异性基因，本期主要用到 TissueEnrich 的 teGeneRetrieval 功能函数，该函数可探索任意物种的组织特异性表达基因。文章发表teGeneRetrieval函数：组织特异性表达基因识别在基因组学研究中，组织特...阅读全文&... 阅 读 全 部 >