选自medium机器之心编译参与：曹瑞、李泽南在完成 Jeremy Howard 非常出色的深度学习第一部分课程之后，我查看了一下我的亚马逊网络服务（AWS）账单，发现我每个月运行 GPU 都要花费差不多 200 美元。以这样的代价来完成网络课程看起来代价有点大，而且我已开始着手研究一些课程以外的数据集，并迫切地想得出结果。通过与大家进行交流，阅读了大量博客文章之后，我最终决定开始配置自己...阅... 阅 读 全 部 >
安装系统是折腾软件的起点与保障，可以免除后顾之忧，放心大胆地去玩耍(注意重要资料的备份)。这次就介绍一款系统U盘启动制作软件：Rufus。大小只有1M左右，功能全面，界面简洁，写入速度快，兼容性好。尽管尺寸很小，Rufus仍可提供您所需的一切！Rufus是一个实用程序，可帮助格式化和创建可启动的U盘。您可以直接将下载好的ISO镜像（Windows，Linux，UEFI等）写入U盘并制作成可引...... 阅 读 全 部 >
这段时间许多童鞋在后台问，TRIzol裂解的细胞能做翻译组测序（Ribo-seq）吗？今天统一回复下。图 (A)核糖体保护mRNA足迹不被消化；(B)将足迹与基因组比对，可以显示出哪些mRNA正在翻译以及翻译水平高低上图是Ribo-seq简化的实验流程图。Ribo-seq实验是这样做的：快速收获细胞并裂解，保持体内核糖体结合mRNA的位置。然后用RNase I对细胞裂解液进行消化处理（Nucl..... 阅 读 全 部 >
首先，让我们先回顾一下分子生物学的基本知识。人类细胞中的DNA序列长度约1828.8毫米，而细胞核的直径只有5微米，那么，如何将这些DNA装入核中是细胞面临的一个巨大挑战。好在DNA并不是裸露地存在于细胞核中，它们由核小体折叠缠绕，形成可以调节的结构。这就意味着DNA序列不能简单地理解为按照一维线性排列，而应该是具有三维折叠和环套状态的结构。我们知道DNA重测序，转录组测序，甲基化...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
作者：丁点helper来源：丁点帮你前面我们已经讲完两组比较的非参数检验，类似t检验与方差分析，当比较的数据超过两组时，我们就需要换一个方法了。非参数K-W检验，相比前文讲解的Mann-Whitney 检验就是这样，我们可以把它理解为“非参数检验的方差分析”。K-W检验的全称为，Kruskal-Wallis检验，它是用于正态分布条件不满足情况下，多组独...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
前段时间为大家介绍过绝对定量转录组测序可以为研究工作带来的改善，你还记的吗？图1 绝对定量转录组测序建库原理绝对定量转录组测序是这样做的：使用含有UMI标签（或Barcode）的接头与cDNA连接，然后进行PCR文库扩增和上机测序（图1）。定量更准确由于每个cDNA扩增产物都带有unique的UMI标签，在数据分析时，通过识别UMI标签，就可以容易地识别哪些序列是PCR扩增产生的（相同的UMI），... 阅 读 全 部 >