2020 01-28 Windows下的微生物(16S/18S/ITS)差异分析神器 一、STAMP软件介绍可以说STAMP软件[1][2]是专为微生物研究量身定制,可以在微生物的物种丰度以及功能丰度信息基础上进行统计分析,以及图形化处理,官方网址为:http://kiwi.cs.dal.ca/Software/STAMPSTAMP软件目前已经经历了version1到version2的更新,引用量高达260。STAMP软件是基于python编写的,除了windows版本外也有Lin... 阅 读 全 部 >
2020 01-05 生信分析必须了解的4种文件格式 在做生物信息的过程中,经常需要进行各种文件格式。每一种生物软件都有固定的文件格式要求。因此,需要非常每一种数据的文件格式,从某种意义上来说,生物信息分析的过程就是进行各种文件格式的转换过程。例如当前很多分析都可以概括为从fastq到bam,从bam到vcf的过程。fasta文件格式FASTA文件主要用于存储生物的序列文件,例如基因组,基因的核酸序列以及氨基酸等,是最常见的生物序列格...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2019 01-20 16S 基础知识、分析工具和分析流程详解 16S概念什么是16S?S是什么意思?16S分析是用来干嘛的?能分析什么?16S大致的分析原理是什么?有点生物学基础的会知道16S和核糖体有关,但大多数还是搞不清楚它们之间的关系。先明确一些概念:核糖体:Ribosome,由 RNA(rRNA)和蛋白质 组成,配合 tRNA 来翻译 mRNA。核糖体按沉降系数来分类,S就是沉降...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >