ATAC-Seq剖析教程系列ATAC-Seq剖析教程:ATAC-seq的布景介绍以及与ChIP-Seq的异同ATAC-Seq剖析教程:原始数据的质控、比对和过滤ATAC-Seq剖析教程:用MACS2软件call peaksATAC-Seq剖析教程:对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估(一)phantompe...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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2023
01-01
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ATAC-Seq分析教程:用网页版工具做功能分析和motif分析—科研必备表观遗传学知识
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ATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析—科研必备表观遗传学知识
一、根底知识1. 解密表观遗传学的三个方向与测序办法1. 探究染色质的敞开性(chromatin accessibility)ATAC-seq: Assay of Transposase Accessible Chromatin sequencingDNase-seq: DNase I hypersensitive sites sequencingFAIRE-s...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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ChIP-seq基础入门(chip-seq流程)—科研必备表观遗传学知识
理解ChIP-Seq到了目前这个水平,我学习新的高通量数据分析流程时已经不再考虑代码应该如何写的问题了。我更多要去考虑一个技术的目的和意义。转录组主要研究的问题是基因在不同情况下的差异表达以及RNA结构变化等,而表观组研究的问题是在基因序列不变的情况下,基因的表达、调控和性状发生了可遗传变化的分子机制。也就是相同的DNA, RNA,蛋白质经过一定的修饰后会使得生物性状发生了改变。...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >