2022
08-29
08-29
如何让单细胞分群更简单
10X Genomics测得的单细胞数据是包含细胞及其表达量在内的高维数据,无论是PCA还是tSNE都是纯数学的数据降维方式,以此得到的细胞分群不具有生物学意义,故而我们通常需要赋予细胞分群以生物学含义即完成细胞亚群到细胞亚型的映射。在这一过程中,我们需要解决两个问题:(1)已知细胞亚型的鉴定,如外周血样品中鉴定红细胞、单核细胞等对应哪些细胞亚群;(2)未知细胞亚群或罕见细胞亚型的鉴定,如肝脏样品... 阅 读 全 部 >