实验动物是生物医学研究中不可或缺的工具，在探究基因基础功能，探寻疾病发病机制以及药物临床前筛选等方面有着十分重要的作用。小鼠是应用最为广泛的一种实验动物。其原因在于小鼠和人的基因具有极高的相似度（小鼠99%的基因能在人类基因组中找到同源基因），同猴子、猪等实验动物相比，小鼠繁殖和饲养很便宜；而且小鼠繁殖迅速，这就使得科研人员可以研究不同代次间小鼠生物学特性的变化。目前，实验室中最常见的小鼠品系大概... 阅 读 全 部 >
来源（首发）：微信公众号《技能Tools》是不是有的小伙伴论文都发了好几篇了，但对一些期刊的专业术语还云里雾里，这期为大家介绍一些国内外学术期刊的一些基本常识情况，投稿前对一些期刊常识有个大概的了解，做到心里有底。由于文章涉及内容比较多，先来个小目录理理。国内期刊核心期刊所谓核心期刊其实就是由一定的遴选体系筛选而产生的期刊，目前，在国内一共有七大核心期刊遴选体系...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
Long long ago, 科学家们发表自己的研究论文都要通过各路学会，得到科研大佬的认同。强如牛爵爷要发论文，也要经过伦敦皇家学会的专家审稿通过。这种方法最大的问题就是，效率低下，而且太注重科学家的个人声望（牛顿和胡克之争）。到后来越来越多的期刊出来了，成为了发表科研论文的主流途径，一开始期刊少的时候选择还比较简单，可以凭经验选择。但在2017年，光SCI就收录了8856份自然科学领域的期刊。... 阅 读 全 部 >
解螺旋公众号·陪伴你科研的第1709天不会编程也可以快速绘制小提琴图。小提琴图（Violin plots）是箱线图与核密度图的结合，因其形态类似小提琴而得名。小提琴图在文献中使用很多，下图是国际知名期刊PNAS（美国科学院院报）2017年上的小提琴图：小提琴图一般使用R语言绘制，那么不会编程该如何绘制小提琴图呢？Graphpad Prism是由Graphpad公司推出的一款非常实用的集医学绘图、统... 阅 读 全 部 >
以下内容转载自“医咖会”微信公众号（medieco-ykh），作者李侗桐。上一期我们讨论了单因素方差分析，本期“科研加油站”栏目，我们一起来探讨双因素方差分析(Two-way ANOVA)。问题与数据某研究者已知受教育程度可以影响政治兴趣，即如果将受试者的受教育程度分为“School”、“College”和“University”3个等级（级别依次递增），他们对政治的兴趣随受教育程度的增加而增加。... 阅 读 全 部 >
以下内容转载自“医咖会”微信公众号（medieco-ykh），作者李延龙。上一期我们讨论了单因素重复测量方差分析，本期 “科研加油站”栏目，我们一起来探讨两因素重复测量的方差分析。问题与数据某研究者拟评估海水淹溺后残留于肺内的海水是否可导致严重的肺损伤，建立动物模型。将12只杂种犬随机分为两组，一组海水灌注右肺，另一组海水灌注全肺，每组6只。每只犬分别于海水灌注前以及灌注后5min、30... 阅 读 全 部 >
做过转录组的同学肯定对KEGG代谢通路图不陌生，今天就跟大家分享怎么看懂KEGG代谢通路图，ko、map等开头的代谢图有啥区别？里面的点、线、不同颜色都代表什么含义。KEGG Pathway分类一般，KEGG中存在三大类代谢图，每个数据路的pathway都有相应的唯一编号，如map00010，据此可在kegg数据库官网查询：第一类、reference pathway：根据...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
由微生物线、转录组线、小RNA线、蛋白代谢线四个小组组长带领各队组员“浴血奋战”， 经过“重重考验”，数次修改，本篇文章过关斩将，脱颖而出！快来和小编一起观摩这篇优秀的文章吧感谢其他三条线的小组成员的参与，下一篇精彩文章的主笔就是你们！如果你是个地地道道生物科研人，当你想要形象地展示不同分组之间表达量的差异时，第一个被激活的idea是啥？——肯定是热图无疑了。它色彩鲜艳、分明，...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
转载请注明：解螺旋·临床医生科研成长平台如果你的研究要带上生信，总得了解一下热图，这是最常用的一种数据表现手法了，号称入门必备技术。尤其多用于展示各种基因或RNA在不同样本中的表达，观察其表达模式。但一堆堆的色块让人眼花缭乱，背后的分析方法更让人不知从何下手。今天我们先来初步探一探门道。读热图的解读一幅典型的热图如下，最显眼的是中间像浴室地砖一样的小色块铺成的一片板子，那就是热图本身。本...阅读... 阅 读 全 部 >
利用16S/ITS多样性测序，可以准确了解群落的微生物组成，同时也可以大概的了解群落功能组成情况。因为16S、ITS的功能预测能在一定程度上代替宏基因组、宏转录组的群落功能的分析，所以是现在微生物比较热门的分析点。16S的功能预测有四个相关软件，分别是PICRUSt[1]、Tax4Fun[2]、FAPROTAX[3]、BugBase[4]ITS的功能预测相关软件是FUNG...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >