众所周知，全基因组关联分析（GWAS）是研究动植物复杂性状的重要手段。利用GWAS分析可以快速获得影响目标性状表型变异的染色体区段或基因位点。但传统GWAS分析存在一些不足，如难以确定具体功能突变，难以解析突变如何影响性状的具体机制，并且有些高阶表型难以定性定量。图1 整合多种类型的组学数据解析基因型-表型间的关联因此，利用中间分子作为表型进行GWAS分析逐渐成为GWAS研究的热点。mGWAS (... 阅 读 全 部 >
本期文章将给大家介绍基因分型策略的相关知识： 1. 四种基因分型技术简要比较 对于GWAS 研究，关键就是需要对目标群体的每个个体开展全基因组水平的基因型检测。4种测序策略所能检测的区域有所区别，如下图示意图所示。图1 四种基因分型策略检测区域的示意图，图中绿色长方块代表对应的测序技术所能检测的区域（1 ）全基因组重测序理论上可以检测基因组范围内所有位置的突变信息，常见检测的突变类似包括：SNP ... 阅 读 全 部 >
全基因组关联分析（GWAS）目前已经成为研究复杂性状和疾病遗传变异的有效手段，但是由于群体结构的存在，导致分析结果出现假阳性。经过数十年的发展，新的方法的不断出现，才使得群体结构对分析的影响进一步降低。Timeline of GWAS目前GWAS主要采取两种实验设计，一种是基于情缘关系的群体（Population-based cohorts）设计；另一种是基于无关个体的病例-对照（...阅读全文&... 阅 读 全 部 >