2023 05-14 单基因泛癌+实验验证,就能发表8分+ 导语AHSA1是Hsp90的ATP酶的主要激活剂,然而,AHSA1在肿瘤细胞中的作用仍然未知。背景介绍今天小编为大家带来一篇单基因泛癌生信分析+简单实验验证就发表了8分+期刊的案例。文章于今年六月刚刚发表在Front. Immunol 上, 题目为The Prognostic and Immunotherapeutic Significance of AHSA1 in Pan-Cancer, ..... 阅 读 全 部 >
2023 05-01 综述 | 癌症全基因组关联分析的现状与未来 全基因组关联分析(GWAS, Genome-wide association studies)是研究复杂疾病的遗传基础的策略之一。在肿瘤研究领域中,几乎所有常见恶性肿瘤的GWAS均已完成,并确定了与风险增加相关的450多个遗传变异。这些研究不仅揭示了致癌的新途径,而且还表明了常见的遗传变异大幅增加了许多常见癌症的遗传风险。GWAS有望应用于药物研发和癌症预防,助力精准预测、诊断和治疗。当前G...... 阅 读 全 部 >
2023 04-28 经验分享:癌症研究模型选择需慎重 癌症是一种多阶段的遗传和表观遗传疾病,病因复杂,涉及癌基因和抑癌基因的突变、下调、过表达和缺失等多方面[1]。癌症基因组学的发展已经确认了数千个可能的癌症驱动基因(drivergene),这些基因的突变可以促进肿瘤的发生。一个典型的肿瘤包含2到8个这样的“驱动基因”突变,剩下的突变则是不提供选择性生长优势的“乘客”,驱动基因调节着肿瘤的细胞命运、细胞存活和基因组维持等重要的细胞过程[2]...阅读... 阅 读 全 部 >
2023 04-28 Nature communication | 长读长测序揭示宫颈癌中HPV高分辨率整合及其致癌进展 长读长测序揭示宫颈癌中HPV高分辨率整合及其致癌进展HPV(人类乳突病毒)整合入人类基因组,往往被认为是宫颈癌发展的重要环节之一,但具体的整合位置和机制目前尚未完全被揭示清楚。在本文中,来自浙大医学院附属邵逸夫医院和附属妇产科医院、华中科技大学和温州中心医院等单位的研究者采用Nanopore测序技术,对16 例HPV16阳性的宫颈肿瘤样品进行大规模检测,重点关注 病毒-人基因组整合事件;相关成果发... 阅 读 全 部 >
2023 04-27 综述 | 癌症全基因组关联分析的现状与未来 全基因组关联分析(GWAS, Genome-wide association studies)是研究复杂疾病的遗传基础的策略之一。在肿瘤研究领域中,几乎所有常见恶性肿瘤的GWAS均已完成,并确定了与风险增加相关的450多个遗传变异。这些研究不仅揭示了致癌的新途径,而且还表明了常见的遗传变异大幅增加了许多常见癌症的遗传风险。GWAS有望应用于药物研发和癌症预防,助力精准预测、诊断和治疗。当...阅读... 阅 读 全 部 >
2023 03-26 cBioPortal—癌症基因组学可视化利器 前言随着测序技术的发展,一些大规模的癌症基因组项目,例如癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas ,TCGA)和国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium ,ICGC)收集了大量多维度的癌症基因组数据,同时这也给癌症基因组数据的整合、研究和分析带来了更大的挑战。因此,今天给大家介绍一款比较经典且好用的综合性数...阅读全文... 阅 读 全 部 >