做功能基因定位的生物狗基本都知道，经过10来年的发展，关联分析与连锁分析一样，已经成为一项基本工具，广泛应用于动植物功能基因挖掘中。在动植物（尤其是植物）的关联分析中，TASSEL软件是最早出现的开源软件，相对于其他软件，TASSEL也是使用的最广泛的，您想不想知道在您有了表型、基因型之后，怎么使用TASSEL进行关联分析呢？往下看吧，小编教你啊~先给软件的下载地址 ht...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
群体遗传结构(Structure)指遗传变异在物种或群体中的一种非随机分布。按照地理分布或其他标准可将一个群体分为若干亚群，处于同一亚群内的不同个体亲缘关系较高，而亚群与亚群之间则亲缘关系稍远。群体结构分析有助于理解进化过程，并且可以通过基因型和表型的关联研究确定个体所属的亚群。一般进行群体分析所使用的软件为STRUCTURE，但是STRUCTURE的运行速度较慢，如今Admixture凭借其高速... 阅 读 全 部 >
中文名：百香果染色体水平的参考基因组装可提供对香气生物合成的见解英文名：Chromosome-level reference genome assembly provides insights into aroma biosynthesis in passion fruit (Passiflora edulis)杂志：Molecular Ecology Resources发表时间：2020年12月... 阅 读 全 部 >
作者：微生态编译：微科盟中元，编辑：微科盟茗溪、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载，转载须注明来源《微生态》公众号。导读人类肠道中有胆汁酸7α-去羟基细菌，通过bai操纵子编码的酶从宿主来源的胆汁酸中产生次级胆汁酸，如脱氧胆酸(DCA)。虽然最近的宏基因组研究表明，这些细菌是高度多样化和丰富的，但DCA生产者很少被确认。本文研究了20世纪80年代从人类粪便中分...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
前言2020 年 8 月 27 日，欧易生物与中南大学基础医学院法医系主任郭亚东课题组合作项目，以题为“Chromosome‐level de novo genome assembly of Sarcophaga peregrina provides insights into the evolutionary adaptation of flesh flies”发表在 Molecu...阅读全文... 阅 读 全 部 >
经过软阈值确定，TOM矩阵计算，层次聚类和动态切割后，我们获得了一些基因模块，每个模块里面都可以看成是有共同目的的团伙。为了方便后面纷至沓来的相关性分析，尤其是跟性状的联合分析，现在需要选取出每个模块中的代表人物。这个过程就是寻找每个模块的eigengene(读音: 爱根金)这样，模块信息就变成了，行是eigengene，列是样本的矩阵了，十分简化。...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
撰写：生信小师妹 来源：小张聊科研平台的“ i生信”公众号，微信公众号搜索“ i生信”即可关注/扫描关注见文末#生信分析# #生信发文# #miRNA#自从1993年发现第一个miRNA以来，miRNA相关文章已经发表了15W+，且研究思路主要是基于miRNA的经典机制（详见正文——大多数人看到的miRNA），以至于持续研究20多年后，miRNA已然成了过气明星。...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。2020年03月，《Methods》杂志上发表一篇关于表观组学ChIP-seq分析方法的综述文章，详细介绍了染色质免疫共沉淀（ChIP-seq）的工作流程和高级应用。以下为原文总结分享：一、介绍（Introduction）染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）是表观基因组学研究中的一种主要方法。全基因组的组蛋白...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
Hi-C分析很难吗？生信小白不会写脚本能自己分析吗？当然可以的，今天小编分享了安诺基因Hi–C分析百宝箱里的大宝贝-数据库WashU Epigenome Browser，今天要推荐给大家，让你轻松搞定Hi–C多组学联合分析。这是小编用过最赞的浏览器，没有之一哦，省时省力还省钱！年底将至，如果你的数据还没分析完，快来试试小编今天要推荐的这个神奇的网站吧~WashU EpiGe...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >
想验证miRNA和靶基因的靶向互作？想知道转录因子与启动子的调控机制？想研究启动子的结构？想分析转录因子的转录激活……这些统统可以用双荧光素酶报告基因检测实验来实现，是不是很强大！那么如此强大的实验你了解多少呢？这么多的应用你会不会一脸懵呢？双荧光素酶报告基因到底是个啥“玩意儿”可以进行做这么多的实验？这些问题想要找到答案就跟着小远的文章往下看吧！原理简介荧光素酶（Luc...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >