2023 08-18 离谱!常规分析能发上12+SCI?每个生信人都值得学习!(附代码) 跟着Nature Communication学绘图之Figure 1的绘制大家好,我是阿琛。在前面讲解的内容中,我们学习了数据的预处理,构建Seurat对象,以及后续的降维分析处理及其可视化过程。接下来,我们来看下如何对PCA分析得到的结果进行可视化展示,以及GSEA分析。可以看到,在图中,图c为PCA分析得到的cPC 特征值按等级排序,包括19,188 个特征值。图d为肿瘤样本在 cPC2 上的... 阅 读 全 部 >
2023 03-03 Nature发布最大规模人类基因组序列结构变异(SV)图谱 研究表明,几乎所有生物的表型变异,环境适应和物种形成都与基因组间的结构变异有关。人类基因组既包括蛋白质编码基因,也包括控制这些基因何时表达以及表达到何种程度的调控信息。结构变异(StructureVariantions,简称SVs)是造成物种表型差异的一个重要原因,且与各类疾病,特别是癌症的发生、发展紧密相关,因此研究结构变异非常重要。基因组结构变异通常是指长度大于1Kb的基因组序列变异,包...... 阅 读 全 部 >
2022 05-03 Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这 编译 |生信宝典,May校对 |生信宝典生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础 、 高颜值在线绘图和分析 、转录组分析 ( Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这 )、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程 )、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 )、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医...阅读... 阅 读 全 部 >