分类目录归档：科研&学习

2022
01-08

雅思A类、G类、UKVI傻傻分不清？看这篇就够了

很多小伙伴常常会问到雅思的问题：听说有好几种雅思考试？我这种情况要考哪种雅思？UKVI雅思是不是比普通雅思简单？雅思一年考几次？什么时间考试？...今天，小申菌就来解答大家的疑问。带上小本子，认真做好笔记哦！一、雅思考试类型雅思考试分成三大类：普通雅思考试用于英国签证及移民的雅思考试（UKVI）和雅思生活及技...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >

2022
01-03

技能篇 | 新版PubMed使用教程

一、Pubmed 更 新PubMed已经更新一段时间了，今天带大家重新了解下操作技巧。01 广撒网，多捞鱼在科研课题决定之初，利用Pubmed进行充分的文献调研早已是一件家常便饭的事情，然而让人头疼是，在搜索关键词后，跳出的结果大多不是自己想要的剧情，很多与关键词不匹配的文章充斥其中，无疑加大了研究者文献筛选的工作量。 举个栗子，打开Pubmed网页之后，在检索框中，输入...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >

2022
01-02

技能篇 | NCBI的5种常见使用方法（二）

一、查找基因序列、mRNA序列进入NCBI 主页，在 search 后面选择 Gene，输入需要查找的基因的名字，点击search，查看结果。以基因P53为例，搜索结果如图：点击红框部分，进入并下拉，可以看到大量的信息，如下图：二、用Probe查找已经公布的引物序列进入NCBI主页，在下拉菜单选择Probe之后填写需要查找的基因名称。...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >

2022
01-01

一文初识NCBI数据库（一）

NCBI (National Center for Biotechnology Information), 美国国家生物技术信息中心俗话说，民以食为天，而科研则以数据为天。NCBI包含的各类数据库无疑是科研数据积累的宝藏。今天，小编就用一文带你初步认识NCBI数据库。官方网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/NCBI 开发有 Genba...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >

2021
12-26

R语言数据处理——数据合并与追加

数据结构的塑造是数据可视化前重要的一环，虽说本公众号重心在于数据可视化，可是涉及到一些至关重要的数据整合技巧，还是有必要跟大家分享一下的。在可视化前的数据处理技巧中，导入导出、长宽转换已经跟大家详细的介绍过了。今天跟大大家分享数据集的合并与追加，并且这里根据所依赖函数的处理效率，给出诺干套解决方案。数据合并操作涉及以下几个问题：横向合并；1. 是否需要匹配字段1.1 匹配字段合并 1.1.1 主字... 阅 读 全 部 >

2021
12-22

PBS 作业管理系统使用总结

前面我们所给出的各个例程一般都是在单台计算机上直接使用 mpiexec 或 mpirun 执行的，但是在实际应用中，对规模比较大的高性能计算任务，一般会提交到集群或超级计算机平台上进行计算。集群系统具有低成本、高性能的特性，提供了强大的批处理和并行计算能力，代表了高性能计算机发展的新方向。在集群或者超级计算机平台上，一般不能随意地直接以 mpiexec 或 mpirun 运行我们的并行计...阅读... 阅 读 全 部 >

2021
12-06

BSA你真得懂了吗?

早在1991年，一位来自法国的生物学家Michelmore首次将BSA技术应用到莴苣的霉病抗性基因位点的验证之中，他利用RFLP和RAPD两种标记对两个不同抗性的莴苣混合样本进行探究，根据不同混池样本的RFLP和RAPD凝胶电泳成像结果，最终找到了3个与霉病抗性基因紧密相关的标记[1]，这一结果标志着BSA的“诞生”，由此拉开了BSA的序幕。高通量测序技术的不断发展，推进了BSA技...阅读全文&... 阅 读 全 部 >

2021
12-01

最新HGVS基因突变命名规则速览

导读：随着二代测序技术临床应用的不断增加，越来越多与癌症发生发展密切相关的突变被鉴定出来。将基因突变的结果更好地转化为实际临床应用，统一而通用的突变命名规则就显得尤为重要。人类基因组变异协会（HGVS：Human Genome Variation Society）规则是目前学术界所公认的命名规则。从不同的维度出发，相同的基因突变可以有多种不同的表现形式，例如，参考序列的不同、表...阅读全文>... 阅 读 全 部 >

2021
11-29

人类基因组变异学会（HGVS）基因突变命名规则

人类基因组突变学会（Human Genome Variation Society，HGVS）已建立系统的基因突变命名方法，是目前学术界所公认的命名规则。具体基因突变命名方法可查阅网站http://www.HGVS.org/varnomen。HGVS基因突变命名指南根据需求不断更新。HGVS官方网站遗传信息的流动遵循中心法则，即从DNA传递给转录后的RNA，后者进一步修饰后再翻译...阅读全文>... 阅 读 全 部 >

2021
11-28

扫盲贴：基因上的这些符号究竟是什么鬼？ 基因究竟是如何命名的？

转载请注明：解螺旋·临床医生科研成长平台关于基因，它早期的名称可以说是毫无章法，命名全凭研究者的个人喜好以及天马行空的想象力，比如果蝇里的吸血鬼基因（dracula，怕光）、蓝精灵基因（Smurf，调控SMAD）、冰山美人基因（Icebox，突变后对异性示好无感）、都铎王朝基因（tudor，无后）等等。显然，这种杂乱的命名方式，总会让科研者与基因面对面时感到一脸懵逼且无所适从，尤其不利于科研者对基... 阅 读 全 部 >