GENEPOP是一个非常实用的群体遗传学分析软件 ,适用于对大量的群体遗传学数据进行分析。下面我们就来介绍一下它的使用方法。操作步骤先用GenAlEx把数据转为Genepop格式格式转好了放到程序目录下，删除其他之前运行剩下的结果文件，仅保留三个文件运行软件，输入输入文件的名称确认信息，回车可以进行很多项分析一共有8个选项：1.Hardy-Weinberg test:进行种群内各位点的平衡状态及种... 阅 读 全 部 >
系统发育树系统发育树（phylogenetic tree），又称系统发生树、演化树、进化树、系统树、系统演化树、种系发生树等。表明被认为具有共同祖先的各物种之间的演化关系树形图，用来描述物种之间的分类和演化关系。自达尔文时期，很多生物学家希望用一棵树的形式，描述地球上各个物种的演化史。最理想的方法，就是采集各个物种的化石（直接证据），基于化石信息构建系统树。但是最大的缺点就是化石零散、不完整，甚至... 阅 读 全 部 >
BSA在遗传学、基因组学和育种中的应用摘要以前生物学分析需要基于样本群体中的所有个体开展，但是混合样本分析（Bulked sample analysis, BSA）这种通过挑选个体并进行混合分析的方法渐渐在遗传绘图方面得到了广泛运用，方式包括构建双亲本遗传群体、测序重要基因突变体或是对极端突变体进行GWAS分析等。与传统的基于整个样本群体的分析相比，BSA显著降低了测序的规模（数据量）和花...阅... 阅 读 全 部 >
SNP-index这个词，作为BSA的最常用的核心算法，给出的是BSA类项目最重要的QTL定位结果。SNP-index通过结果的可视化，可以非常直观地看出BSA定位得到的QTL在基因组上的位置。例如下图是一个典型的SNP-index的展示结果：上图中，第一行和第二行分别代表两个子代极端性状混池的SNP-index结果，第三行是两个子代池的△SNP-index的结果。通过第三行我们可以看出，QTL被... 阅 读 全 部 >
ATAC-Seq （Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing）作为表观遗传学研究技术大家庭中的重要成员，已经在越来越多的研究中得以应用。其技术原理见：https://mp.weixin.qq.com/s/fVXgsHm8FNtkJFTFZuIQZQ。今天，我们来带大家看...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >