GENEPOP是一个非常实用的群体遗传学分析软件 ,适用于对大量的群体遗传学数据进行分析。下面我们就来介绍一下它的使用方法。
操作步骤先用GenAlEx把数据转为Genepop格式格式转好了放到程序目录下,删除其他之前运行剩下的结果文件,仅保留三个文件
运行软件,输入输入文件的名称 确认信息,回车 可以进行很多项分析 一共有8个选项: 1.Hardy-Weinberg test:进行种群内各位点的平衡状态及种群整体平衡状态的检验,选1回车开始Hardy-Weinberg test, 选择1,回车 然后连续三个回车,按默认参数进行,得到结果。 2.genotypic disequilibrium:进行连锁不平衡的分析,选2进入,选1进行分析 3.population differentiation:进行遗传分化的检验 4.Nm estimate:对基因流进行估计 5.Allele frequencies,various Fis,gene diversities:估计等位基因频率 6.Fst:估计群体间联系 7.file conversion:进行格式转换,可以转换为FSTAT格式的 8.Null alleles:计算无效等位基因
好了,以上就是Genepop教程,希望对你有所帮助。如果对Genepop的使用有什么问题欢迎评论区留言讨论。
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