责编 | 兮在众多的组蛋白修饰中，基因活化状态的标志物组蛋白H3上第4位的赖氨酸三甲基化（H3K4me3）是被研究得最为广泛的PTMs之一，在哺乳动物细胞中其可以被6种不同的COMPASS复合物催化生成【5-8】。由于H3K4me3在基因启动子附近的富集水平与基因表达水平正相关，因此长久以来H3K4me3一直被认为是可以促进基因转录起始的。这一假说可以被一些体外生化实验结果得以支持；此外，蛋白质谱... 阅 读 全 部 >
ATAC-Seq （Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing）作为表观遗传学研究技术大家庭中的重要成员，已经在越来越多的研究中得以应用。其技术原理见：https://mp.weixin.qq.com/s/fVXgsHm8FNtkJFTFZuIQZQ。今天，我们来带大家看...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >
ChromImpute是一款用于大规模系统表观基因组分析的软件。在大规模的系统表观组学分析中，缺失值的存在是不可避免的，为了尽可能的减小缺失值对结果的影响，这个时候我们就需要一款这样的软件，可以基于大量的数据集进行训练，从而对缺失值进行科学的插补，达到即使存在缺失值也不对最终的结果形成影响的效果。上图是经ChromImpute处理的数据，可以看到，蓝色部分是真实的观察值，红色部分是插值后的结果，经... 阅 读 全 部 >