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2023
08-18

生物医学软件大全 这个你必须要知道

搞生物、基础医学同学如果对生命科学领域所有软件都了如指掌，那做事情必然会事半功倍。如果你对这些不了解，那就听师兄给你一一道来。下面的内容比较多，平时可以将下面的内容作为目录来收藏，权当做工具辞典来用。长话短说，切入正题。1. 三维分子类RASMOL：观看生物分子 3D 微观立体结构RasTop：为 RasMol 2.7.1 的图形用户界面软件...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023
08-17

绝佳干货： 生物软件大全

在科研领域“升级打怪”，怎能少了生物软件，以下是生物软件兵器库，任君挑选！1. 三维分子RASMOL：观看生物分子3D微观立体结构RasTop：为RasMol 2.7.1的图形用户界面软件CHIME：直接在浏览器中观看3D分子MolMol：将pdb等格式的蛋白文件通过微调，存成普通的图形文件raswin.exe.gz：rasmol(...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023
01-14

欧易BSA测序&RNA-seq助力解析类胡萝卜素对玉米籽粒质地调节作用

前言2020年10月22日，中科院上海植物生理生态研究所/分子植物卓越中心巫永睿课题组于Nature Communications（IF：12.121）上在线发表玉米籽粒发育最新研究成果。通过对自然群体的极端表型混池测序分析（BSA测序）筛选到控制玉米硬（透明）/粉（不透明）质的主效数量性状位点Ven1（vitreous endosperm 1），Ven1编码 β-胡萝卜素羟化酶...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
2022
10-03

被引10万次：21世纪高被引论文Top 10

21世纪是生命科学的世纪。人类基因组DNA测序计划的完成，RNA干扰技术、干细胞技术、CRISPR/Cas9基因编辑技术等一系列重大生物技术的诞生，极大推动了生命科学的发展，为保障人类健康、提高人类生活质量提供了重大技术支撑。而21世纪全球经济的迅猛发展、科研合作的深度融合，也推动了全球高质量科研产出的快速增长。今天，我们一起来了解下21世纪头20年被WOS数据库收录（SCIE论文）的全...阅读... 阅 读 全 部 >
2022
09-30

小众但对科研帮助非常大的数据库--引物、结构域、功能

一：GETPrime数据库我们经常为寻找基因和特定转录本的qPCR引物所犯难，不用怕，在GETPrimer你可以得到所有基因的引物，并且考虑了SNP等情况。直接可视化设计出来基因的位置。二 InterPro分析蛋白的相关结构域信息三 ReFOLD蛋白质3D模型的细化可以被认为是蛋白质结构预测的“终末游戏”。通常需要对预测模型进行微妙的改进，将它们移动到“最后一公...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022
09-30

生物极客大讲堂 | 教你如何设计gRNA

第一步 确定您想要定位的基因组区域您需要首先找到哪些外显子存在于您的靶基因的所有转录物中。要在Benchling中获取此信息，请点击右上角的“create”，然后点击“create CRISPR”。 在下一个对话框中，您可以搜索您感兴趣的基因。以下是在人类基因组（hg38）中搜索Ano6的示意图。在Advanced Settings中，您可以选择所有转录物以在基因组上应用注释。...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2022
05-11

ChromImpute—一款大型系统生物学表观组学分析软件

ChromImpute是一款用于大规模系统表观基因组分析的软件。在大规模的系统表观组学分析中，缺失值的存在是不可避免的，为了尽可能的减小缺失值对结果的影响，这个时候我们就需要一款这样的软件，可以基于大量的数据集进行训练，从而对缺失值进行科学的插补，达到即使存在缺失值也不对最终的结果形成影响的效果。上图是经ChromImpute处理的数据，可以看到，蓝色部分是真实的观察值，红色部分是插值后的结果，经... 阅 读 全 部 >
2022
04-07

科普 | 靶向和非靶向性代谢组学分析技术简介

代谢组学(Metabolomics)是生物体内生化反应的总成，是生命体维持生命的物质基础，也是研究生命活动的重要基础。代谢组学是基于高通量分析和生物信息学技术，研究生命在内、外环境影响下的内源代谢活动，包括对代谢产物种类、数量及其变化规律的检测和分析，从而研究集体生命活动发生和发展的本质。代谢物作为生物学过程的终端产物，其状态改变能够准确地反应细胞功能的变化。研究表明，包括癌症在内的多种疾病...... 阅 读 全 部 >
2022
03-03

二氧化碳培养箱的使用注意事项，您都知道了吗？

二氧化碳培养箱的使用注意事项，您都知道了吗？二氧化碳培养箱目前已经成为细胞体外研究和生产的重要工具。本文整理了一些关于二氧化碳培养箱的使用注意事项，希望这些信息能够帮助各位科研君们正确规范使用二氧化碳培养箱及提高实验效率。一、二氧化碳培养箱使用前1、仪器应放置在平整的地面或者台面上，环境应清洁整齐，干燥通风。2、仪器使用前，各控制开关均应处于非工作状态。3、水套式二氧化碳培养箱未注水前不...阅读... 阅 读 全 部 >
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