2022 09-30 小众但对科研帮助非常大的数据库--引物、结构域、功能 一:GETPrime数据库我们经常为寻找基因和特定转录本的qPCR引物所犯难,不用怕,在GETPrimer你可以得到所有基因的引物,并且考虑了SNP等情况。直接可视化设计出来基因的位置。二 InterPro分析蛋白的相关结构域信息三 ReFOLD蛋白质3D模型的细化可以被认为是蛋白质结构预测的“终末游戏”。通常需要对预测模型进行微妙的改进,将它们移动到“最后一公...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022 09-30 生物极客大讲堂 | 教你如何设计gRNA 第一步 确定您想要定位的基因组区域您需要首先找到哪些外显子存在于您的靶基因的所有转录物中。要在Benchling中获取此信息,请点击右上角的“create”,然后点击“create CRISPR”。 在下一个对话框中,您可以搜索您感兴趣的基因。以下是在人类基因组(hg38)中搜索Ano6的示意图。在Advanced Settings中,您可以选择所有转录物以在基因组上应用注释。...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2020 01-24 二代测序中barcodes index的介绍 刚接触高通量测序的同学,可能会接触到barcode index等名词。为什么要有barcodes ?原因很简单,一个lane有效数据30来G我们并常常不可能拿一个样品测那么大数据量,尤其是RNA-seq,哈哈,所以在建库的时候,对每一个样品接头上加上不同的标签序列,然后用于测序,在测序结果中,依据之前标签与样品的对应关系,就可以获得对应样品的数据,从而...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >