2022 03-07 使用OpenCV测量图像中物体的尺寸大小 首先,您需要知道类似于比例的概念称为每度量比的像素(pixels per metric ratio)。近似含义是每个单位指标中包含的像素数。例如,图表上的1厘米包含100张图像。实际上,相当于引用对象的作用,例如已知地图上的引用材质,我们可以使用此引用对象将其转换为地图上其他对象的大小。引用对象需要具有两个重要属性:属性#1:我们应该以可测量的单位(例如毫米...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022 02-20 Nature genetics:番茄泛基因组揭示番茄新基因及调控果实风味的稀有等位基因 什么是泛基因组?泛基因组(pan-genome)作为一个概念出现的时间并不长,相应的研究文献也并不多。但它作为基因组学研究积累到一定阶段而出现,在更大尺度上进行的研究,甫一面世便受到了研究者广泛的关注。泛基因组(pan-genome)指一个群体中所有基因组的总和,其中前缀pan来源于希腊语“παν”(指全部)。泛基因组通过对一个物种中多个个体或是一个分类群体中多个物种的基因组信息进行分析...阅读... 阅 读 全 部 >
2022 02-11 10分钟带你了解泛基因组做些什么(干货) 近年来,越来越多的研究表明,单一或者少数参考基因组不能涵盖整个种群全部的遗传信息,所以,构建物种的泛基因组成了当前基因组学研究的热点和前沿。本篇文章,小编和大家一起来了解一下泛基因组的构建方式、泛基因组的热点研究内容。一、泛基因组的构建策略泛基因组构建主要分为以下三种方式[1]:(1)选取一个参考基因组,各个材料的测序reads分别比对,将未比对上的reads进行组装,通过“比对-组装”的迭代过程... 阅 读 全 部 >
2022 02-06 如何提取gff文件中的基因注释信息 gff3格式注释文件是最常见的基因注释,(https://archive.broadinstitute.org/annotation/argo/help/gff3.html)简单来说,gff3是以tab分隔的文本文件,共有9列,对应信息如下:1、seqname The name of the sequence. Typically a chromosome or a contig. Argo ..... 阅 读 全 部 >
2022 02-03 功能基因组学研究利器——Hi-C 前期的推文中我们介绍了一种基于末端标签序列研究染色质交互作用的方法(ChIA-PET),本期中,我们再介绍一种应用更加广泛的染色质三维结构信息捕获方法——Hi-C.一、Hi-C技术的发展一提到Hi-C,我们不得不先说下它的老祖宗,3C,即Chromosome Conformation Capture。2002年,Job Dekker团队在《Science》发文,首次报道了...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
2022 02-02 又一伟大计划:ENCODE(DNA元件百科全书) 二十一世纪之初,在多国科学家的共同努力下,人类基因组草图被成功绘制。但让人们大吃一惊的是在人类基因组中能够编码蛋白质的基因只占整个人类基因组的不到2%,其余超过98%的人类基因组是做什么的还不清楚,有科学家把这些DNA叫做“垃圾DNA”,或基因组里的“暗物质”。为了解析这些所谓“垃圾DNA”的结构和功能,在2003年由美国人类基因组研究所(NHGRI)和欧洲生物信息研究所(EMBL)牵头,开展了E... 阅 读 全 部 >
2022 01-23 你可知道“小奶猫”英语怎么说? 自盘古开天辟地以来,世间出现过不少能让人血流满地的“凶兽”,包括但不限于:饕餮、年兽、小奶猫及小奶狗等……WHAT?汪星人和喵星人都算?不过,爱好英语学习,又爱好萌宠的你,是否知道奶喵及奶汪的英文怎么说吗?可别想当然地说little milky cat,正确说法是什么呢?Kitten – 小奶猫不用说大家都知道猫咪的英文就是cat,这个词,是猫这种动物的总称。比如:T...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022 01-22 进化树的构建与美化 1.进化树1.0版本上一期已经给大家介绍根据基因或者蛋白ID在NCBI上进行BLAST并下载FASTA序列,然后将序列导入MEGA软件中进行比对,最后生成.meg的序列比对文件。那么用这个文件是不是就能构建进化树呢,当然可以。方法也很简单,单击菜单【File】→【Open A File/Session】,打开上述.meg文件,点击工具栏中的【PHYLOGENY】→【C...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022 01-16 聊一聊 QTL 定位的原理 通过前两周的《本地化适应是怎么发生的?》和《突变是否影响个体的适应性?》了解了群体的核酸多样性后,我们接下来就开始要着手进行功能基因的定位了。工欲善其事,必先利其器。在我们可以自由选用各类实验设计前,我们需要了解各种方法的基本原理。让我们先从连锁分析开始。1. 连锁分析的基本原理既然群体中产生了多样性,我们就期望将与性状相关的基因定位出来。在之前的文章中,我们提到功能基因定位的方法主要包...阅读... 阅 读 全 部 >
2022 01-12 澳门雅思考试报名及攻略分享 前几天有烤鸭催着小编要澳门考试攻略,那小编加班加点,综合了两位烤鸭 “动动” 和 “静静” 的澳门考雅思经历,汇总成一篇,送给有需要的烤鸭~~前记自从决定了要去新西兰,雅思A类4个7就列入了日程。和很多雅思小白一样经历了到处加群找资料咨询机构之后,得出的结论是---中国大陆雅思压分!尤其口语和写作!鉴于我已经是非英专的工作五年的大龄通讯狗,对自己实在没有信心。于是离广东很...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >