2020
01-24
01-24
二代测序中barcodes index的介绍
刚接触高通量测序的同学，可能会接触到barcode index等名词。为什么要有barcodes ？原因很简单，一个lane有效数据30来G我们并常常不可能拿一个样品测那么大数据量，尤其是RNA-seq，哈哈，所以在建库的时候，对每一个样品接头上加上不同的标签序列，然后用于测序，在测序结果中，依据之前标签与样品的对应关系，就可以获得对应样品的数据，从而...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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刚接触高通量测序的同学，可能会接触到barcode index等名词。为什么要有barcodes ？原因很简单，一个lane有效数据30来G我们并常常不可能拿一个样品测那么大数据量，尤其是RNA-seq，哈哈，所以在建库的时候，对每一个样品接头上加上不同的标签序列，然后用于测序，在测序结果中，依据之前标签与样品的对应关系，就可以获得对应样品的数据，从而...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2020
01-05
01-05
生信分析必须了解的4种文件格式
在做生物信息的过程中，经常需要进行各种文件格式。每一种生物软件都有固定的文件格式要求。因此，需要非常每一种数据的文件格式，从某种意义上来说，生物信息分析的过程就是进行各种文件格式的转换过程。例如当前很多分析都可以概括为从fastq到bam，从bam到vcf的过程。fasta文件格式FASTA文件主要用于存储生物的序列文件，例如基因组，基因的核酸序列以及氨基酸等，是最常见的生物序列格...阅读全文&... 阅 读 全 部 >