2022 07-09 16S从实验到数据分析最全流程 本文主要介绍了16S的实验、建库、数据分析等过程,也是我自己近期的一个小总结,初学之时从很多前辈的无私分享中受益良多,在此也和大家分享一些我的见解,当然我也只是一个初学者,还有很多不完备之处,希望能与各位一起交流分享。导航本文一共分为三个部分:实验部分建库测序16S测序数据分析一. 实验部分:DNA提取与质检1...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022 03-23 宏基因组:扩增子测序常用数据库整理与介绍 微生物扩增子测序是研究微生物组成的重要方法,且成本较低,是许多课题组的首要选择。扩增子测序数据分析最主要的一个材料就是扩增子数据库,用来与测序数据进行比对,并进行物种注释,主要收录了微生物的16S,18S个ITS序列信息。扩增子数据库版本较多,本期就对主流的扩增子数据库进行一个详细的整理和介绍,以便大家选择使用。1. GreenGenes网址:http://greengenes.s...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2021 08-14 Protein Cell:扩增子和宏基因组数据分析实用指南 扩增子和宏基因组数据分析实用指南A practical guide to amplicon and metagenomic analysis of microbiome dataProtein Cell [IF: 10.164]DOI: https://doi.org/10.1007/s13238-020-00724-8Review: 2020-5-11第一作者:刘永鑫1,2,3, 秦媛1,2,3... 阅 读 全 部 >