基因表达的改变是植物适应环境变化的一种机制。热是一种非生物胁迫，可以在许多方面影响植物。平均温度的微小变化会导致平均产量的降低。繁殖期间严重的热胁迫事件会导致结实率的重大变化。营养早期的热胁迫事件会导致叶片衰老和生长速率降低。植物转录组分析发现，许多基因在非生物胁迫下表现出转录物丰度的变化。热休克因子(HSF)转录因子(tf)在热胁迫下被激活，并通过与顺式作用元件的相互作用调节许多基因的表达...... 阅 读 全 部 >
上上上期靠谱er在连锁分析和关联分析的稿子（ 关联分析和连锁分析 | 群体遗传专题 ）最后留了个尾巴，这次就把这个尾巴续上，讲讲连锁分析和关联分析的文献案例。总览玉米籽粒相关性状和产量直接相关。本文通过关联群体和双亲杂交群体解析三个籽粒性状（籽粒长度，籽粒快递，籽粒厚度）的遗传基础。在四种环境下共检测到21个和以上三个性状关联的位点。另又在7种环境下通过B73和Mo17构建的D...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
软件及参考基因组BWA, Samtools, Hisat2, HTseq, gffcompare, Stringtie, Ballgown，RB73-V3, B73-V4(Enzampl database)流程protocol首先从原始RAN-seq数据入手，先经过质控fastqc，之后检测rRNA占比，去除杂的reads之后进行数据处理；使用HISAT2将读段匹配到参考基因组上,可提...阅读全... 阅 读 全 部 >