2023
05-14
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选好基因，单基因泛癌发7分+也不难！
作者：作图丫导语GUIDE ╲CDCA4（细胞分裂周期相关蛋白4）参与细胞周期调节，是癌症的潜在的生物标志物。背景介绍2022年啦，单基因泛癌生信还可以发高分吗？当然是可以的！今天小编给大家带来一篇刚刚发 表在Front Immunol（IF=7.6）的单基因泛癌文章，本文的所有生信分析部分基本都是使用数据库或者web工具完成的，很有借鉴意义。 题目为 ...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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基因序列到进化树：轻松掌握多物种DNA序列比对与进化分析
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MEGA:多序列比对软件的下载与安装
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ESPript：轻松绘制多序列比对结果，打造出版级Figure！
作者：作图丫导语GUIDE ╲CDCA4（细胞分裂周期相关蛋白4）参与细胞周期调节，是癌症的潜在的生物标志物。背景介绍2022年啦，单基因泛癌生信还可以发高分吗？当然是可以的！今天小编给大家带来一篇刚刚发 表在Front Immunol（IF=7.6）的单基因泛癌文章，本文的所有生信分析部分基本都是使用数据库或者web工具完成的，很有借鉴意义。 题目为 ...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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Linux运维工程师必须掌握的基础技能有哪些？
linux运维工程师比较适合新手入门，但如果你想要持续发展，获得更高的薪资，那我建议你以云计算架构师&SRE工程师为目的，从而来学习Linux运维工程师的技能。这两者之间有什么关系呢？成为SRE工程师，中间需要经历两个阶段，一是Linux运维，二是Linux云计算工程师，三者之间是递进和包含关系，这意味着SRE工程师掌握的技能，Linux运维一定也具备，但Linux运维不会...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
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如何使用 lftp 来加速 ftp/https 下载速度 | Linux 中国
lftp 是一个文件传输程序。它可以用于复杂的 FTP、 HTTP/HTTPS 和其他连接。-- Vivek Gite致谢编译自 | https://www.cyberciti.biz/tips/linux-unix-download-accelerator.html作者 | Vivek Gite译者 | geekpi 阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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单基因泛癌+实验验证，就能发表8分+
导语AHSA1是Hsp90的ATP酶的主要激活剂，然而，AHSA1在肿瘤细胞中的作用仍然未知。背景介绍今天小编为大家带来一篇单基因泛癌生信分析+简单实验验证就发表了8分+期刊的案例。文章于今年六月刚刚发表在Front. Immunol 上， 题目为The Prognostic and Immunotherapeutic Significance of AHSA1 in Pan-Cancer, ..... 阅 读 全 部 >
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4+无代码纯生信：基因家族套路解析
2021年新的开始，现在还能靠纯网页分析发高分生信吗？答案是：YES！今天给大家介绍的是去年9月份发表在 frontiers in Oncology (IF=4.848)的一篇文章，主要内容是基因家族chromobox在结直肠癌中的预后价值及免疫浸润的综合分析。 这篇文章里运用到网页工具如下：Oncomine、Gene Expression Profiling Interactive Analy... 阅 读 全 部 >
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带你一网搞定基因间错综复杂关系
在分子机制的研究中，寻找基因间互作网络是非常重要的。基因间的关系，又可分为蛋白与蛋白之间，蛋白与 DNA之间的相互作用、通路、生理生化反应、共表达、共定位等等。下面介绍一下GENEMANIA数据库，你想知道的数据全都有，网址 http://genemania.org/1打开网址页面如下，首先在网站左上角，有一个搜索栏2输入你想查询的基因名称，点击前面的图标可以选择物种3点击搜索后，可以看到如下界面... 阅 读 全 部 >
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基于短核苷酸序列频率构建细菌系统发育树
目前，原核生物的系统发育分类依赖于16S rRNA基因序列，这种序列在细菌中广泛存在且高度保守，但即使16S rDNA测序的结果显示某些细菌间序列相似性≥99%，但它们仍然不能被归为同一物种。因为基因序列中的一些保守区域并不一定代表真正的进化历史，水平基因转移也可能会影响分析结果。为此研究人员开发了一种方法，并为该方法创建了一个web应用程序Phy5，以及它的命令行版本Phy5cl...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
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TCGA RNA-seq数据更新后的下载与读取
1.TCGA RNA-seq数据更新情况2022年3月29日，GDC官网(https://portal.gdc.cancer.gov/)发布了新的更新版本(Data Release 32.0)数据。此次数据更新范围广、变化大，导致许多网上的教程一夜之间不再直接可用。具体的更新情况，在官网页面(https://docs.gdc.cancer.gov/Data/Release_Notes/Data_R... 阅 读 全 部 >
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甲基化分析实战，将你的数据用在刀刃上！
2020年4分+甲基化生信文章复现领悟生信文章逻辑之美，小伙伴们大家好呀，我是风间琉璃。上一周我们品读了2020年10月发表在《Frontiers in oncology》杂志上的文章“ A Novel Promoter CpG-Based Signature for Long-Term Survival Prediction of Breast Cancer Patients”。作者使用CHAM... 阅 读 全 部 >
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这篇最新二区7分 +SCI太牛了！平平无奇，零代码就能搞定？到底好在哪里 ？
今天给大家带来的复现比较经典文章是来自2区的Frontiers in Immunology杂志，影响因子高达7.5分！题目是： Hepcidin Upregulationin Lung Cancer: A Potential Therapeutic Target Associated With Immune Infiltration要素拆解题目：肺癌中铁调素升高可以作为潜在的免疫相关的治疗靶标 疾... 阅 读 全 部 >