一篇带你搞定Meta分析全过程！5000+字纯干货
写了几个月的Meta分析被人抢先发表！原来是差了这一步！
做Meta分析必须知道的科研神器
宝塔面板安装了FTP服务器Pure-Ftpd 1.0.49后，远程登陆FTP可以登陆成功，但是发现目录无法读取列表出来，这种情况大都出现在被动端口或远程服务器发回了不可用的路由地址所致。原因分析读取目录列表失败的原因有以下两种：1、未开放FTP端口21；2、未开放Pure-Ftpd被动端口范围(端口范围39000~40000)，导致无法使用被动模式进行连接通信；3、远程...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
蛋白激酶是一类在细胞内发挥关键调控作用的蛋白质，被广泛视为细胞调控网络的“主宰者”，其在细胞信号传导、生理调节和疾病治疗领域中的关键作用，使其荣膺生物医学研究中的“重要之星”，是药物研发中备受关注的靶点之一。2022年，FDA批准上市的37种新药中，就有5种药物属于小分子激酶调节剂。针对激酶的药物研究旨在调控相关生物学过程，从而对抗疾病。作为生物分子世界中的调控“大师级”元素，如何应用生信分析解析... 阅 读 全 部 >
CRAN安装R包CRAN (Comprehensive R Archive Network) 是 R 语言的官方仓库，几乎所有主流的 R 包都可以通过 CRAN 安装。镜像设置建议使用CRAN安装R包前，将镜像设置为离您较近的镜像点，这里推荐清华大学提供的CRAN镜像，选择后，保存即可。CRAN镜像设置安装时可以点击Packages标签内的Instal...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
Patch-seq是一种结合了膜片钳记录技术（patch-clamp electrophysiology）、单细胞转录组测序（single-cell RNA sequencing）和形态学分析的新兴技术。这种方法能够在同一个细胞中同时获得电生理特性、基因表达数据和形态学特征。2020年在细胞代谢期刊上发表了题为《Patch-Seq Links Single-Cell T...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >
上一期我们介绍了Rstudio的安装：详细教程 | 手把手教你安装Rstudio部署生信环境 本期我们一起来认识下Rstudio的界面探索 RstudioRStudio是一个集成开发环境（IDE），为R语言设计，提供了编写、测试和调试R代码所需的所有工具。其界面设计旨在提高R语言开发者的效率，包含多个面板和选项卡，每个都有特定的功能。以下是对RStudio界面主要部分...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
必备软件Aspera 插件 下载网址 ： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra_sub/sub.cgi“每个过程对应的网址：NCBI注册 网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/申请BioProject 网址：https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
本期小编将分享关于小基因组数据NCBI上传流程，那小基因组包含哪些基因组呢？小基因组主要包括线粒体、叶绿体、病毒、质粒等，由于这些基因组大小通常小于1M，因此统称为小基因组。基于高通量测序技术，对小基因组进行全基因组测序，可以得到其全基因组序列，并预测其重要的功能基因。基于全基因组序列，对于线粒体/叶绿体可以进一步研究物种分类、进化关系等；对于病毒、质粒可以则可以进一步研究致病性、...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
高通量测序时代，大量的原始测序数据都流向了NCBI的SRA数据库。尽心尽责的将文章有关的测序数据上传至公共平台发布，一方面，是对生物领域科学研究的奉献，方便数据再利用，进行新探索；另一方面，可进行数据分析重现、验证等，为课题研究的真实性提供依据。 但是，很多操作过数据上传的小伙伴们都发现，认真做好这件事可真不容易，成功拿到传说中的SRA accession number（序列检索号码）仿佛经历..... 阅 读 全 部 >
每年的1-3月份是很多老师撰写国自然本子的主要时期，但是每年这个时期都会有老师因为各种各样的原因，导致实验计划延迟而拿不到需要的实验数据，因此需要借助数据库已有的数据做数据分析为基金申请做理论支撑。另外由于很多突发的因素产生，科研人员往往无法及时开展实验工作，因此更需要借助数据库数据，这在今年的新冠肺炎疫情中体现特别明显，在疫情发生的早期，就陆续发表了多篇研究论文，分析讨论新冠肺炎病毒靶向蛋白血管... 阅 读 全 部 >
引很多老师在写文章的时候，精力通常会放在文章中的技术或者实验细节，而疏忽原始数据上传的工作。文章准备接收时，审稿人需要老师提供文章中使用数据的登录号，一般时间要求较紧，对于没接触过数据上传的老师来说，可能会成为文章接收最后的绊脚石，为此我们撰写了一份高通量测序数据上传指南，可以让老师快速掌握数据上传的技能，助力老师文章发表。目前高通量测序原始数据通常上传到NCBI的SRA(The ...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
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