Ensembl数据库|常用基因组数据库介绍
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LabMaker光遗传分子层面不同的纹状体黑质神经元亚型对运动有着不同的调节作用
糖尿病是一种以血糖升高和代谢紊乱为主要特征的疾病，属中医学“消渴病”范畴。其中2型糖尿病占所有糖尿病患者的95%左右，严重威胁人类健康[1]。2型糖尿病又称为非胰岛素依赖型糖尿病，多发于肥胖及中老年人群，患者体内胰岛素分泌相对不足或作用效果不佳。2型糖尿病可诱发多种并发症，包括糖尿病心血管疾病、糖尿病肝病、糖尿病肾病等。临床上治疗2型糖尿病一般分为注射胰岛素和口服降糖药2种方案。然而，这2种方案的... 阅 读 全 部 >
在过去的20年中，生物学家和化学家一直致力于开发一种高效和先进的药物发现和评价系统［1］，不仅可以高效率地发现靶向治疗药物，而且可以降低潜在药物不良反应的发生风险。为了减少新药开发的时间并降低费用，科研人员将目光转向了基于计算机和大数据的方法，如虚拟筛选（VS）和分子对接，但这些方法具有准确性差和效率低等问题［2］。人工智能（AI），包括深度学习（DL）和机器学习（ML）算法，有望可以克服在药物设... 阅 读 全 部 >
DisGeNET数据库是一个与疾病相关的基因数据库，整合了来自各种存储库（包括孟德尔，复杂和环境疾病）的人类基因疾病协会（GDA）和变异疾病协会（VDA）的信息。具体技术包括对基因-疾病词汇的mapping、DisGeNET本体分析。网址：https://www.disgenet.org/目前的版本DisGeNET v4.0，包含17,381个基因，15,093 种疾病、异常和...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
第一步：获取歌曲ID打开网易云音乐，随意选择一首歌曲，在浏览器网址中或客户端分享歌曲链接中复制歌曲的ID。 例如，《我曾》这首歌的ID为1336856777。第二步：获取歌曲直链获取歌曲ID后，直接拼接获取歌曲的直链。 例如，《我曾》这首歌的直链为：[http://music.163.com/song/media/outer/url?id=13368...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
GenAlex是一款应用于EXCEL的生物数据分析工具插件，运行后可以在Windows的excel中使用，功能强大又好上手。它可以对共显性数据、单倍体数据和二元数据进行分析。GENALEX还提供了一系列基于频率的分析， 20多种不同的图表总结数据辅助检测。除此之外，序列信息和基因型数据可以方便地在相关软件中转化格式。操作步骤建立一个表格，第一行首先写上位点数，个体数，居群数，然后开始与第二行对应标... 阅 读 全 部 >
裸花紫珠Callicarpanudiflora Hook. et Arn为马鞭草科紫珠属植物，干燥叶入药，主产于海南、广东、广西等省份，是海南省道地药材和黎药大品种，为《中国药典》2020年版唯一新增收载药材，具有消炎、解肿毒、化湿浊、止血等功效[1]。课题组前期对海南岛裸花紫珠种质资源进行调查，发现生产上尚无优势品种，人工栽培种苗大部分来源于自留种，长期以来会导致种质混杂，药材产量与质量参差不齐... 阅 读 全 部 >
Structure是由斯坦福大学Pritchard实验室开发的一款群体结构分析软件。structure可通过贝叶斯聚类方法对每个样本的来源进行判断，进而反应群体的遗传结构。真正跑时burnin设为100000，跑100000代，k设为1-20，每轮运行10次。序列文件用xmfa2struct转为structure可识别的格式，SSR用Genalex转为structure可识别的格式。操作步骤打开s... 阅 读 全 部 >
GENEPOP是一个非常实用的群体遗传学分析软件 ,适用于对大量的群体遗传学数据进行分析。下面我们就来介绍一下它的使用方法。操作步骤先用GenAlEx把数据转为Genepop格式格式转好了放到程序目录下，删除其他之前运行剩下的结果文件，仅保留三个文件运行软件，输入输入文件的名称确认信息，回车可以进行很多项分析一共有8个选项：1.Hardy-Weinberg test:进行种群内各位点的平衡状态及种... 阅 读 全 部 >
选自Authorea参与：路雪、刘晓坤、李亚洲arXiv 是当前最流行的预印本库。自 1991 年创办以来，arXiv 为研究者提供了一个在正式同行评议之前分享预印本文章的平台。新技术使文档创建和分发更加便捷，文化实践推动合作和数据共享，这使得 arXiv 快速发展，日渐流行。arXiv 在研究交流和 Web 历史上占据独特的位置，但是它自创建以来几乎很少改变。在此文章中，我们看一下 ...阅读全... 阅 读 全 部 >
选自 Medium作者：Eddie Smolyansky参与：刘晓坤、王淑婷还在机器学习论文的海洋里忘我沉沦？先花几分钟学些新工具，不亏，论文阅读、评论、社交、管理、搜索、复现、写作全不误。作为像深度学习这样高产领域的研究人员，我们经常会发现自己被论文的汪洋所淹没。这些论文是如此之多，想全部读完并跟踪最新研究似乎很难很难。我觉得形成这种局面的一个重要原因是，我们没有充分利用现有工具和服务来让工作变... 阅 读 全 部 >