2023
06-18
06-18
单细胞转录组高级分析一:多样本合并与批次校正
01前言实际的科研项目中不可能只有一个样本,多样本的单细胞数据如何合并在一起,是否需要校正批次效应呢?先上一张图说明多样本scRNA数据的批次效应:左边的图简单地把多个单细胞的数据合并在一起,不考虑去除批次效应,样本之间有明显的分离现象。右边的图是使用算法校正批次效应,不同的样本基本融和在一起了。scRNA数据校正批次效应的算法有很多:MNN, CCA+MNN, Harmony, Scanor..... 阅 读 全 部 >