导语GUIDE ╲韦恩图用于展示在不同集合之间的数学或逻辑联系，尤其适合用来表示集合（或）类之间的“大致关系”。背景介绍可视化和提取多个基因数据集的独特（不相交）或共有子集是生物信息学经常做的工作。尽管有许多包和Web应用程序可以绘制韦恩图，但没有R包提供提取这些子集的细节并将其与数据框中的用户数据集结合起来的功能。 今天小编给大家介绍的是 VennDetail...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
韦恩（Venn）图是常见统计图之一，用于展示各样本（或分组）之间共有（或特有）元素的数量（或比例）。例如做RNA-seq的最直接目的，大多是鉴定差异表达的基因。当试验涉及到多分组情况时，常需要展示多组间共享的差异基因数量，这个时候就要使用到韦恩Venn图。例如以下示例，植物组织中响应7天氮缺乏（-N_7d）、7天磷酸盐缺乏（-Pi_7d）和盐胁迫（d）、冷胁迫（e）或干旱胁迫（f）...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
在我们平时的工作中，经常会遇到小伙伴咨询，怎么样能对高通量测序的数据进行挖掘呢，有没有比较详细的文章能介绍一下呢。鲁迅先生曾说过，这世上本没有路，走的人多了，便也就成了路。同样的，问的人多了，自然方法也就来了。我们将历来的经验进行汇总，得出了一个常见数据挖掘方法：图1.转录组数据挖掘常用方法根据上面的图所示，转录组的数据挖掘可以从三个方面入手：表达量、功能和寻找“明星”入手，今天我们先来了解一下表... 阅 读 全 部 >
韦恩图(Venn diagram)，也叫维恩图、文氏图、温氏图等。即数学中的集合。目前韦恩图软件眼花缭乱，但选择一款适合自己的并非易事，毕竟要求和眼界也是越来越高，面对各式各样的R包，想找出符合自己要求的图更是难以抉择。本文主要介绍12个R语言中的韦恩图软件绘制，让您绘制心目中的韦恩图不再困难。1vennnetwork韦恩网络图点评：该包暂时未开源，为百迈客云研发独有。韦恩网络图对每个交集均得到.... 阅 读 全 部 >
此处结合微生物群落研究中的16S扩增子分析数据，给大家分享怎样在R中进行韦恩图（Venn plot）和花瓣图（Flower plot）绘制。 在R中，可用于绘制韦恩图的R包有很多可供选择，本文中选择了VennDiagram、venn、UpSetR共3个R包进行介绍。同时在本篇博文的最后，给出了3个可在线绘制韦恩图的网站，以提供更多的可选方法。 作图示例文件、R脚本等，已上传至百度盘，无提取码（若失... 阅 读 全 部 >