2022 06-28 韦恩图只能画5组?不存在的。 最近,云平台小姐姐被5组韦恩图魔咒环绕,困扰不已。所以,翻了一堆资料,终于找到原来还有进阶版展示交集情况的结果图。那就让我们一起来看看,到底是何方神圣如此强大。云平台网址:https://www.lc-bio.cn/tool/43## 致谢首先的首先,让我们给生信前辈大神们致敬,比如在此感谢大名鼎鼎的Y叔叔,请收下小侄(迷)女(妹)们崇拜的追随目光。感谢前辈对于经验和技能的无私分享(转UpSe..... 阅 读 全 部 >
2022 06-28 韦恩图的绘制及交集元素的提取(R包VennDiagram) 韦恩(Venn)图是常见统计图之一,用于展示各样本(或分组)之间共有(或特有)元素的数量(或比例)。例如做RNA-seq的最直接目的,大多是鉴定差异表达的基因。当试验涉及到多分组情况时,常需要展示多组间共享的差异基因数量,这个时候就要使用到韦恩Venn图。例如以下示例,植物组织中响应7天氮缺乏(-N_7d)、7天磷酸盐缺乏(-Pi_7d)和盐胁迫(d)、冷胁迫(e)或干旱胁迫(f)...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2022 06-28 绘制进阶版Venn图—UpSetR包 Venn图经常用于表现组间重叠元素的数量信息。但是随着分组数量的增多,Venn图的结构会越渐复杂,如下所示,当分组数量为5组时,已经不容易从中识别交集概况了。因此,这也是为什么很少见到5组以上的Venn图的原因。3组、4组、5组的韦恩图样式,分组越多越复杂可是有些时候,确实有待于展现大于5组的集合。如果不使用Venn图,应该怎样做呢?此时不妨试下UpSet图,它是在较多分组条件时取代Ve...阅读... 阅 读 全 部 >
2020 01-27 绘制韦恩图(Venn plot)和花瓣图(Flower plot)的几个常用R包及在线网站 此处结合微生物群落研究中的16S扩增子分析数据,给大家分享怎样在R中进行韦恩图(Venn plot)和花瓣图(Flower plot)绘制。 在R中,可用于绘制韦恩图的R包有很多可供选择,本文中选择了VennDiagram、venn、UpSetR共3个R包进行介绍。同时在本篇博文的最后,给出了3个可在线绘制韦恩图的网站,以提供更多的可选方法。 作图示例文件、R脚本等,已上传至百度盘,无提取码(若失... 阅 读 全 部 >