最近,云平台小姐姐被5组韦恩图魔咒环绕,困扰不已。所以,翻了一堆资料,终于找到原来还有进阶版展示交集情况的结果图。那就让我们一起来看看,到底是何方神圣如此强大。
云平台网址:https://www.lc-bio.cn/tool/43
## 致谢
首先的首先,让我们给生信前辈大神们致敬,比如在此感谢大名鼎鼎的Y叔叔,请收下小侄(迷)女(妹)们崇拜的追随目光。感谢前辈对于经验和技能的无私分享(转UpSet图为ggplot? )。本着继续发扬这样的精神,和为广大科研工作者尽心服务的宗旨,我们联川的云平台工程师在新版的upset绘图包基础上,结合前辈的分享的经验,将这个进阶版的venn图展示工具——upset绘图,搬到了我们的联川生物云平台上。广大科研工作者,可以在我们的云平台上免费进行使用。
## upset展示图介绍
接下来,噔噔噔噔,一起来认识一下upset的真面目:
Upset展示图的主要内容可分为3部分:
(1)左侧柱状图展示各原始数据集中包含的元素总量;
(2)下方交集点的部分,通过横向的对应关系,用点指代左侧的对应数据集名称。通过纵向实现点与点之间的连接,来表示对应数据集之间存在交集的情况。即,通过点与点之间的连接,对应传统韦恩图中圈与圈的重叠。
(3)通过纵向的对应关系,对应上方柱状图,表示该交集情况下的交集元素数量。
## 云平台功能介绍
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3种常见输入文件格式,供您任意选择
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在upset基本图形上叠加直观的圈图,可要也可不要,想放哪里就放哪里,就是这么任性
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光画图就好了吗?那当然不是,我们要给您更好的服务。想查什么信息,您想要的,这里都有
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图画完了,下载PPT。天哪,它……竟然可以拆分组件,堪比图片编辑器。
好了好了,啥都不说了,我要赶紧去联川生物云平台试试去~
参考文献:
[1] Lex A, Gehlenborg N, Strobelt H, et al. UpSet: visualization of intersecting sets[J]. IEEE transactions on visualization and computer graphics, 2014, 20(12): 1983-1992.
[2] Conway J R, Lex A, Gehlenborg N. UpSetR: an R package for the visualization of intersecting sets and their properties[J]. Bioinformatics, 2017, 33(18): 2938-2940.
[3] https://mp.weixin.qq.com/s/g6rRGhtKQd_mdRMKxteNVw
[4] https://github.com/GuangchuangYu/yyplot
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