2024 08-21 测序数据上传NCBI怎么又报错了? 高通量测序时代,大量的原始测序数据都流向了NCBI的SRA数据库。尽心尽责的将文章有关的测序数据上传至公共平台发布,一方面,是对生物领域科学研究的奉献,方便数据再利用,进行新探索;另一方面,可进行数据分析重现、验证等,为课题研究的真实性提供依据。 但是,很多操作过数据上传的小伙伴们都发现,认真做好这件事可真不容易,成功拿到传说中的SRA accession number(序列检索号码)仿佛经历..... 阅 读 全 部 >
2023 06-04 不看后悔!GEO数据库10X单细胞测序原始测序测序数据(fastq)下载指南来啦 每年的1-3月份是很多老师撰写国自然本子的主要时期,但是每年这个时期都会有老师因为各种各样的原因,导致实验计划延迟而拿不到需要的实验数据,因此需要借助数据库已有的数据做数据分析为基金申请做理论支撑。另外由于很多突发的因素产生,科研人员往往无法及时开展实验工作,因此更需要借助数据库数据,这在今年的新冠肺炎疫情中体现特别明显,在疫情发生的早期,就陆续发表了多篇研究论文,分析讨论新冠肺炎病毒靶向蛋白血管... 阅 读 全 部 >
2022 10-01 不看后悔!GEO数据库10X单细胞测序原始测序测序数据(fastq)下载指南来啦 每年的1-3月份是很多老师撰写国自然本子的主要时期,但是每年这个时期都会有老师因为各种各样的原因,导致实验计划延迟而拿不到需要的实验数据,因此需要借助数据库已有的数据做数据分析为基金申请做理论支撑。另外由于很多突发的因素产生,科研人员往往无法及时开展实验工作,因此更需要借助数据库数据,这在今年的新冠肺炎疫情中体现特别明显,在疫情发生的早期,就陆续发表了多篇研究论文,分析讨论新冠肺炎病毒靶向蛋白血管... 阅 读 全 部 >
2022 07-26 MAC版: 保姆式SRA Toolkit下载原始数据 本期和大家分享糯米饭在使用SRA Toolkit下载NCBI-SRA原始数据的一些Tips,时间宝贵,直接上干货。1.明确Project:SRP119720,打开浏览器,输入:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study/?acc=SRP119720&o=acc_s%3Aa2.下载:Accession List「获得SRR_Acc_Lis...阅读全文... 阅 读 全 部 >
2020 10-12 技术帖|手把手教你原始数据上传NCBI 近期收到不少售后咨,老师发表文章需要将数据上传到NCBI数据库,下面小编就把最新版的详细流程介绍给大家,记得收藏哦1、注册NCBI账号如果已经注册过NCBI ,直接登陆。2、登录后转入NCBI主页点击进入“Submit ”( 红框所示)3、选择上传数据的类别如图红框所示,选择“Sequence Read Archive(SRA)”,然...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >