2024 08-18 单细胞数据上传GEO操作指南 最近很多老师的单细胞文章都纷纷开始投稿,却被文章发表前的临门一脚——GEO数据上传难住了,今天我们就来一起学习下单细胞数据上传GEO的具体操作步骤吧~跟着这份操作指南,上传从此不再犯难!· GEO数据库简介 ·GEO数据库全称Gene Expression Omnibus,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库,主要用来储存二代测序、芯片以及其...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2024 08-18 GEO 数据上传指南 在完成了高通量测序分析以后,为了将用户的实验数据与全世界其它研究者共享,在用户的研究转化为论文发表之前,用户需要先向 GEO 数据库上传用户的原始数据。GEO 数据库,全称 Gene Expression Omnibus,中文直译意为“基因表达集锦”,为美国国家生物信息中心(NCBI)管理的基因表达谱和 RNA 修饰谱的数据库。今天小编就为用户介绍 GEO 数据上传的基本操作。在上传数据之前,..... 阅 读 全 部 >
2023 06-04 不看后悔!GEO数据库10X单细胞测序原始测序测序数据(fastq)下载指南来啦 每年的1-3月份是很多老师撰写国自然本子的主要时期,但是每年这个时期都会有老师因为各种各样的原因,导致实验计划延迟而拿不到需要的实验数据,因此需要借助数据库已有的数据做数据分析为基金申请做理论支撑。另外由于很多突发的因素产生,科研人员往往无法及时开展实验工作,因此更需要借助数据库数据,这在今年的新冠肺炎疫情中体现特别明显,在疫情发生的早期,就陆续发表了多篇研究论文,分析讨论新冠肺炎病毒靶向蛋白血管... 阅 读 全 部 >
2022 10-01 干货|原来用GEO数据挖掘还可以这样完整复现一篇SCI 你还在为找不到课题方案而焦虑吗,复现一篇论文吧!你还在为找不到研究思路而苦恼吗,复现一篇论文吧!你还在为找不到数据方法而悔恨吗,复现一篇论文吧!复现?怎么复现?先来看一下某乎上的回答。有道理有道理,感觉也不是很难的样子对不对,聪明的智商又重新占领高地了,此刻我就是华佗再世扁鹊附体,复现没在怕的,摩拳擦掌,跃跃欲试,开整!结果一顿操作猛如虎,代码也写了,夜也熬了,怎么和我想象中的不一样!!!e...... 阅 读 全 部 >
2022 10-01 不看后悔!GEO数据库10X单细胞测序原始测序测序数据(fastq)下载指南来啦 每年的1-3月份是很多老师撰写国自然本子的主要时期,但是每年这个时期都会有老师因为各种各样的原因,导致实验计划延迟而拿不到需要的实验数据,因此需要借助数据库已有的数据做数据分析为基金申请做理论支撑。另外由于很多突发的因素产生,科研人员往往无法及时开展实验工作,因此更需要借助数据库数据,这在今年的新冠肺炎疫情中体现特别明显,在疫情发生的早期,就陆续发表了多篇研究论文,分析讨论新冠肺炎病毒靶向蛋白血管... 阅 读 全 部 >
2022 07-03 实用帖-手把手教你如何上传GEO数据库 还在为不知如何上传GEO数据库而发愁吗?还在为不愿意看繁琐的英文帮助而不知所措吗?一篇帖子教你如何上传GEO数据库,建议收藏,再也不用愁“书到用时方恨少”了。1、创建账号如果要上传GEO数据库,首先要创建NCBI帐号, 网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/submitter/登录成功后,回到GEO的主页,点击 Submissi...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >