4、进入上传入口界面

如下图所示，首先点击进入My profile，填写个人信息并保存，应该注意是NCBI已经取消了向qq.com、163.com和foxmail.com发送邮件，请选择其他邮箱，然后点击“New submission”按钮。

接着进入My profile界面，填写姓名、单位和地址等信息。完成以后，进入到上传的主界面，又有诸多步骤，下面进行详细介绍。

4.1进入Submitter界面

界面显示的是你之前填写的个人信息，直接点击“continue”按钮。

4.2进入General Information界面

该界面值得注意的是数据的公开时间，如果用于发表文章，建议指定公开的日期应该早于投稿日期，因为审稿人可能要查看你的数据，当然后期也是可以调整数据的公开日期的。

4.3进入Project Info界面

给你的实验取个名字并简要描述，然后点击“continue”按钮，如图所示。

4.4进入Sample Type界面

根据你的样本，选择相应的样本类型，如“Micrbe”。

4.5进入Attributes界面

接下来是对样本的描述，可以在线填写表格或者上传表格(需要先下载NCBI提供的表格文件进行填写)。NCBI提供了两种格式的表格供我们下载后填写，分别是TSV格式和xlsx格式。TSV格式也是可以用excel打开，每列表格都有固定的格式，切记要准确填写。这里推荐直接下载excel(xlsx格式)文件。

这里推荐直接下载excel（xlsx 格式） 文件，如下图所示。

首先，表格内容根据你之前所选的样本类型的不同而不同。其次应该注意：绿色字段是必填项；黄色字段是选填项；蓝色字段也是必填项，如果没有取得资料可以填“not collected ”、“not applicable”或“missing”。

在每一列字段的右上角有一个红色三角形的每一列都有一个注释，如果你将鼠标悬停在标题上，可以显示该提示信息。必须按照提示的格式填写，否则会报错。填写还表格后，点击“选择文件”按钮，找到你填写的表格，完成上传。

下图是日期的格式报错的例子，可以看出地址信息填写错误，国名要大写字母开头，中间用冒号分隔(注意不支持中文格式的符号)。遇到这种情况要先点击“Delete”删除上传的文件，根据表格中的提示，重新修改后再上传。

4.6进入SRA metadata界面

与上一步骤类似，先下载表格，填写数据的信息。

SRA metadata表格如下，

该表格分为三个sheet，第一和第三的sheet是一些补充说明。需要填写的是第二个sheet。这里要注意：“sample_name”要与上一步表中“sample_name”相对应，除了“bioproject_accession”可以不填，其他蓝色列必填。

完成表格的更改后，就可以上传了，如果有报错，请根据提示更改表格重新上传。

4.7进入Files界面

进入到该页面后就可以上传数据了，NCBI 提供了多种上传数据的方法，最常用的是浏览器上传和命令行上传。如果数据量少，可以使用浏览器上传，选择就不再赘述了，如下图所示。

如果数据量大，用ftp 或浏览器方法上传，不仅速度慢而且还有会中断的现象。这时候推荐使用Aspera 软件上传数据，其优点是上传速度快，可在windows和linux系统下以命令行运行。

首先，在使用Aspera上传数据之前，需要下载安装Aspera 软件，如下图所示，进入NCBI主页，点击Download。

进入Aspera下载界面，如下图所示。

准入IBM Aspera下载页面，点击下载，然后windows下安装。

安装完成后，进入命令行模式。输入命令行：

首先进入用户目录：C:\Users\10243 (请改成自己的用户名)

然后键入：

“AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\bin\ascp.exe”-i <path/to/key_file> -QT -l100m -k1 -d <path/to/folder/containing files>

[email protected]:uploads/[email protected]_TkJUSuck

注意软件路径加上英文格式的双引号，否则可能会报错。

-i 下载的key file的路径<aspera.openssh>

-I 上传的最大速度<100m>

-d 数据存放的路径(以“\”结尾)这是根据你数据的存放路径来输入的[email protected]:uploads/[email protected]_TkJUSuck 是注册邮箱生成的随机码。

windows系统命令行示例如下：

linux系统下的命令行示例如下：

等待数据上传完成后，点击“Select preload folder”按钮。

然后核实一下信息，上传就快完成了。

回到manage data项，会看见刚才上传的Bioproject，大概一天后就会通过NCBI审核，并邮件通知你，里面会有id信息，或者进入到该界面，自己找到对应的id。

到此，上传数据就算完成了。