2023 04-15 启动子—高效基因表达的钥匙,别选错了!!! 确保外源基因在细胞或者动物体内,持续和高水平的表达具有广泛的应用需求及科研价值。当前递送外源基因的生物学手段,主要是运用质粒或者病毒作为媒介表达基因,而启动子是实现基因表达的基础元件。但是,经常有老师反馈,为什么基因表达不强呢?为什么细胞传代几次之后就不表达了呢?今天,小编带您盘点下,常用的组成型启动子表达效率与细胞的关系。启动子是位于结构基因上游的一段可以行使转录起始功能的序列,...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2023 04-15 【干货】启动子研究方法高质量总结 01 启动子的基本类型启动子是基因的重要组成部分,其主要功能为调控基因表达(转录)的起始时间和表达程度。但启动子本身并不控制基因活动,而是通过与转录因子的结合来控制基因活动。根据启动子对转录水平的调控程度,将其分为弱启动子和强启动子;此外,参照转录模式,其又可被分为:(1)组成型启动子(Constitutive promoter),能够调控基因表达,使其基本恒定在一定程度上,从而使...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2023 04-15 解读神秘的eRNA 在发育和分化过程中基因的表达涉及许多顺式调控DNA元件和反式作用蛋白的复杂机制的调控。调节基因转录的顺式调控DNA元件是启动子,绝缘子,增强子和沉默子。最近,一类被称为增强子RNA(eRNA)的增强子转录的ncRNA被发现,eRNA的长度为0.5-5kb,因此可以分类为lncRNA。启动子是基因近端调控DNA元件,包括基础启动子元件。 基础启动子与一般转录因子相关联,招募和定位RN...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2023 04-05 非洲猪瘟病毒实时荧光PCR检测操作流程 团体标准T/CVMA 5—2018非洲猪瘟病毒实时荧光PCR检测方法Real-time PCR assay for detection ofAfrican swine fever virus中国兽医协会发布前言本标准按 GB/T 1.1-2009给出的规则起草。本标准由中国兽医协会提出并归口。本标准起草单位:中国动物疫病预防控制中心、中国兽医药品监察所、中国农业...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023 03-29 如何在24h内拿到细胞器基因组的进化树 细胞器基因组研究相对于微生物基因组来说,要相对容易的多,因为细胞器基因组不大(高等植物叶绿体基因组大小基本在130~160kb左右,动物线粒体基因组基本都在20kb以内),拷贝数高,GC含量与基因组有较大差别(针对大部分物种),所以在高通量测序技术应用非常普通的今天,细胞器基因组很容易从total DNA测序数据中拼接分离出来。而且,细胞器基因组的基因构成相对很稳定,所以细胞器基因组研究的初步工作... 阅 读 全 部 >
2023 03-28 如何分析TCGA数据之cBioportal网站 今天,小编将为大家介绍一个无需代码,并且免费使用的TCGA子数据库——cBioportal网站。毋庸置疑,这是一个科研汪们集万千宠爱的网站。首先,我们进入网站了解一下。官网网址为http://www.cbioportal.org/。进入官网后,主页分为以下三个区域,左侧的为选择研究的区域(按器官对各肿瘤分类),中间是下载研究数据的区域,右侧区域是对各研究数据的一个总结及该癌种的临床信息。...阅读... 阅 读 全 部 >
2023 03-01 超级增强子鉴定技术 超级增强子概念 超级增强子 (Super enhancer, SE) 是一类具有超强转录激活特性的顺式调控元件,2013年由美国学者Richard A. Young首次提出。与普通增强子 (Typical enhancer, TE) 相比,超级增强子区域跨度范围通常可达8~20Kb,远高于普通增强子...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
2023 02-06 手把手教你做全基因组DNA甲基化测序分析 大家好,这是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。本期,我们讲讲全基因组DNA甲基化实验怎么做,从技术原理、建库测序流程、信息分析流程和研究套路等四方面详细介绍。一、全基因组甲基化测序技术原理表观修饰不需要改变 DNA 序列便能实现对性状的改变,表观修饰的改变与基因功能乃至细胞状态、发育、衰老、疾病等存在重要的关联。在众多的表观遗传修饰中,最为重要且研究最为...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023 01-29 DNA甲基化研究的测序数据挖掘思路:干货分享 作者:易基因总体来说,DNA甲基化一般遵循三个步骤进行数据挖掘。首先,进行整体全基因组甲基化变化的分析,包括平均甲基化水平变化、甲基化水平分布变化、降维分析、聚类分析、相关性分析等。其次,进行甲基化差异水平分析,筛选具体差异基因,包括DMC/DMR/DMG鉴定、DMC/DMR在基因组元件上的分布、DMC/DMR的TF结合分析、时序甲基化数据的分析策略、DMG的功能分析等。...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
2023 01-29 一文读懂工具病毒如何助力国自然研究? 国家自然科学基金可以帮助研究型临床医生和科学家成长,在成长过程中国自然标书的申请,以及成果的转化,是一个永恒的话题。我们知道,国自然的转化成果类型包括:期刊论文、专利、会议论文、奖励、专著。那么工具病毒是如何助力老师们的国自然成果转化呢?为了便于老师们理解工具病毒的功能与应用场景,我从国自然官网上检索出了腺相关病毒[1]、慢病毒[2]、腺病毒[3]助力,国自然成果转化的期刊论文,进行简要解读...... 阅 读 全 部 >