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Bioconductor：助力你的生物信息学研究
基因序列到进化树：轻松掌握多物种DNA序列比对与进化分析
Visual Studio Code 是一款轻量级但功能强大的源代码编辑器，适用于 Windows、macOS 和 Linux。内置了对 Java、Type 和 Node.js 的支持，并为其他语言（例如 C++、C#、Java、Python、PHP、Go）并且提供了丰富的扩展生态系统。今天我将给大家介绍 VsCode 常用操作及非常棒的插件， 喜欢本文记得收藏、点赞、关注...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >
gff3格式注释文件是最常见的基因注释，（https://archive.broadinstitute.org/annotation/argo/help/gff3.html）简单来说，gff3是以tab分隔的文本文件，共有9列，对应信息如下：1、seqname The name of the sequence. Typically a chromosome or a contig. Argo ..... 阅 读 全 部 >
先普及下一些常识：天河二号超级计算机 “天河二号”是由国防科学技术大学研制的超级计算机系统，以峰值计算速度每秒5.49亿亿次、持续计算速度每秒3.39亿亿次双精度浮点运算的优异性能位居榜首，成为全球最快超级计算机。2014年11月17日公布的全球超级计算机500强榜单中，中国“天河二号”以比第二名美国“泰坦”快近一倍的速度连续第四次获得冠军。2015年5月，“天河二...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
▌Dstat & sariostat, vmstat, ifstat 三合一的工具，用来查看系统性能。▌Slurm查看网络流量的一个工具▌Vim & emacs真正程序员的代码编辑器。▌Screen, dtach, tmux, byobu你是不是经常需要 SSH 或者 telent 远程登录到 Linux 服务器？你是不是经常为一些长时间运行的任务而...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
新中国成立以来已经开展了两次全国畜禽遗传资源调查，与前两次调查相比，第三次普查有以下五个特点。第一，区域全覆盖。凡是有畜禽和蜂、蚕遗传资源分布的区域实现全覆盖，将以前未覆盖到的青藏高原区域和边远山区作为重点，共计2300余个县（旗、区）。其中，青藏高原区域和边远山区最有可能发现新遗传资源，是这次普查的重点区域。第二，对象更明确。这次普查包括了列入《国家畜禽遗传资源目录》的猪、牛、羊、鸡、鸭...阅... 阅 读 全 部 >
前期的推文中我们介绍了一种基于末端标签序列研究染色质交互作用的方法（ChIA-PET），本期中，我们再介绍一种应用更加广泛的染色质三维结构信息捕获方法——Hi-C.一、Hi-C技术的发展一提到Hi-C，我们不得不先说下它的老祖宗，3C，即Chromosome Conformation Capture。2002年，Job Dekker团队在《Science》发文，首次报道了...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
二十一世纪之初，在多国科学家的共同努力下，人类基因组草图被成功绘制。但让人们大吃一惊的是在人类基因组中能够编码蛋白质的基因只占整个人类基因组的不到2%，其余超过98%的人类基因组是做什么的还不清楚，有科学家把这些DNA叫做“垃圾DNA”，或基因组里的“暗物质”。为了解析这些所谓“垃圾DNA”的结构和功能，在2003年由美国人类基因组研究所(NHGRI)和欧洲生物信息研究所(EMBL)牵头，开展了E... 阅 读 全 部 >
10月末的时候，我去了一趟西安，在工程热物理会议上做了一个小小的报告。会议间隙里，北京超级云给我推荐了一下他们的超算服务器。万万没想到，我竟然还获得了超算服务器的试用资格。与一般的多节点高性能计算服务器不同的是，它们的服务器不需要把设备运到本地，而是可以在云端操作。这种云超算平台的名字叫超算网格，是基于国家高性能计算环境与云计算技术，提供多家各大超算与数据中心的计算资源、优化网络、...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
1 概述本文章介绍大数据平台Hadoop的分布式环境搭建、以下为Hadoop节点的部署图，将NameNode部署在master1，SecondaryNameNode部署在master2，slave1、slave2、slave3中分别部署一个DataNode节点NN=NameNode（名称节点）SND=SecondaryNameNode（NameNode的辅助节点）DN=DataNode（数据节点）... 阅 读 全 部 >
来自：码农翻身（微信号：coderising）1分布式小明的公司有3个系统： 系统A、系统B和系统C ，这三个系统所做的业务不同，被部署在3个独立的机器上运行， 他们之间互相调用（当然是跨域网络的）， 通力合作完成公司的业务流程。将不同的业务分布在不同的地方， 这就构成了一个分布式的系统，现在问题来了， 系统A是整个分布式系统的“脸面”， 用户直接访问，用户量访问大的时候要么是速度巨慢，...阅读... 阅 读 全 部 >