2022
01-22
01-22
进化树的构建与美化
1.进化树1.0版本上一期已经给大家介绍根据基因或者蛋白ID在NCBI上进行BLAST并下载FASTA序列,然后将序列导入MEGA软件中进行比对,最后生成.meg的序列比对文件。那么用这个文件是不是就能构建进化树呢,当然可以。方法也很简单,单击菜单【File】→【Open A File/Session】,打开上述.meg文件,点击工具栏中的【PHYLOGENY】→【C...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
1.进化树1.0版本上一期已经给大家介绍根据基因或者蛋白ID在NCBI上进行BLAST并下载FASTA序列,然后将序列导入MEGA软件中进行比对,最后生成.meg的序列比对文件。那么用这个文件是不是就能构建进化树呢,当然可以。方法也很简单,单击菜单【File】→【Open A File/Session】,打开上述.meg文件,点击工具栏中的【PHYLOGENY】→【C...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
通过前两周的《本地化适应是怎么发生的?》和《突变是否影响个体的适应性?》了解了群体的核酸多样性后,我们接下来就开始要着手进行功能基因的定位了。工欲善其事,必先利其器。在我们可以自由选用各类实验设计前,我们需要了解各种方法的基本原理。让我们先从连锁分析开始。1. 连锁分析的基本原理既然群体中产生了多样性,我们就期望将与性状相关的基因定位出来。在之前的文章中,我们提到功能基因定位的方法主要包...阅读... 阅 读 全 部 >
前几天有烤鸭催着小编要澳门考试攻略,那小编加班加点,综合了两位烤鸭 “动动” 和 “静静” 的澳门考雅思经历,汇总成一篇,送给有需要的烤鸭~~前记自从决定了要去新西兰,雅思A类4个7就列入了日程。和很多雅思小白一样经历了到处加群找资料咨询机构之后,得出的结论是---中国大陆雅思压分!尤其口语和写作!鉴于我已经是非英专的工作五年的大龄通讯狗,对自己实在没有信心。于是离广东很...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
很多小伙伴常常会问到雅思的问题:听说有好几种雅思考试?我这种情况要考哪种雅思?UKVI雅思是不是比普通雅思简单?雅思一年考几次?什么时间考试?...今天,小申菌就来解答大家的疑问。带上小本子,认真做好笔记哦!一、雅思考试类型雅思考试分成三大类:普通雅思考试用于英国签证及移民的雅思考试(UKVI)和雅思生活及技...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
一、Pubmed 更 新PubMed已经更新一段时间了,今天带大家重新了解下操作技巧。01 广撒网,多捞鱼在科研课题决定之初,利用Pubmed进行充分的文献调研早已是一件家常便饭的事情,然而让人头疼是,在搜索关键词后,跳出的结果大多不是自己想要的剧情,很多与关键词不匹配的文章充斥其中,无疑加大了研究者文献筛选的工作量。 举个栗子,打开Pubmed网页之后,在检索框中,输入...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
一、查找基因序列、mRNA序列进入NCBI 主页,在 search 后面选择 Gene,输入需要查找的基因的名字,点击search,查看结果。以基因P53为例,搜索结果如图:点击红框部分,进入并下拉,可以看到大量的信息,如下图:二、用Probe查找已经公布的引物序列进入NCBI主页,在下拉菜单选择Probe之后填写需要查找的基因名称。...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
NCBI (National Center for Biotechnology Information), 美国国家生物技术信息中心俗话说,民以食为天,而科研则以数据为天。NCBI包含的各类数据库无疑是科研数据积累的宝藏。今天,小编就用一文带你初步认识NCBI数据库。官方网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/NCBI 开发有 Genba...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
数据结构的塑造是数据可视化前重要的一环,虽说本公众号重心在于数据可视化,可是涉及到一些至关重要的数据整合技巧,还是有必要跟大家分享一下的。在可视化前的数据处理技巧中,导入导出、长宽转换已经跟大家详细的介绍过了。今天跟大大家分享数据集的合并与追加,并且这里根据所依赖函数的处理效率,给出诺干套解决方案。数据合并操作涉及以下几个问题:横向合并;1. 是否需要匹配字段1.1 匹配字段合并 1.1.1 主字... 阅 读 全 部 >
前面我们所给出的各个例程一般都是在单台计算机上直接使用 mpiexec 或 mpirun 执行的,但是在实际应用中,对规模比较大的高性能计算任务,一般会提交到集群或超级计算机平台上进行计算。集群系统具有低成本、高性能的特性,提供了强大的批处理和并行计算能力,代表了高性能计算机发展的新方向。在集群或者超级计算机平台上,一般不能随意地直接以 mpiexec 或 mpirun 运行我们的并行计...阅读... 阅 读 全 部 >
早在1991年,一位来自法国的生物学家Michelmore首次将BSA技术应用到莴苣的霉病抗性基因位点的验证之中,他利用RFLP和RAPD两种标记对两个不同抗性的莴苣混合样本进行探究,根据不同混池样本的RFLP和RAPD凝胶电泳成像结果,最终找到了3个与霉病抗性基因紧密相关的标记[1],这一结果标志着BSA的“诞生”,由此拉开了BSA的序幕。高通量测序技术的不断发展,推进了BSA技...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
生信圈
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