2023 05-02 联合多数据集分析也能像这篇文章简单发3+ 天跟大家分享的是2020年4月发表在Mol. Carcinog.(IF:3.411)杂志上的一篇文章Alternative splicing related genetic variants contribute to bladder cancer risk.在文章中作者作者通过CancerSplicingQTL数据库搜索了位于膀胱癌的sQTL中的SNPs。进行了一项包括580例病例和1,...阅... 阅 读 全 部 >
2023 05-02 单细胞联合还能这样玩,单细胞和EQTL联合分析确定疾病机制和潜在的治疗方法 毫无疑问多组学联合的实验设计对于解析生物学问题是十分有效且敏感的。相对于单组学来说,起到的是1+1>2的作用。多组学就像是一条河流,从最初的DNA(基因组)到转录水平(转录组)以及解析来进行翻译(蛋白组),以及下游对于代谢物质的研究(代谢组)。同时还有多种表观修饰发挥作用(表观组学),不同的外部微生物环境也会造成差异(微生物组)。从变异或者表达水平单方面去解析生物学问题,毫无疑问在当今...... 阅 读 全 部 >
2022 01-16 聊一聊 QTL 定位的原理 通过前两周的《本地化适应是怎么发生的?》和《突变是否影响个体的适应性?》了解了群体的核酸多样性后,我们接下来就开始要着手进行功能基因的定位了。工欲善其事,必先利其器。在我们可以自由选用各类实验设计前,我们需要了解各种方法的基本原理。让我们先从连锁分析开始。1. 连锁分析的基本原理既然群体中产生了多样性,我们就期望将与性状相关的基因定位出来。在之前的文章中,我们提到功能基因定位的方法主要包...阅读... 阅 读 全 部 >