分类目录归档：学习课程

2022
01-08

雅思A类、G类、UKVI傻傻分不清？看这篇就够了

很多小伙伴常常会问到雅思的问题：听说有好几种雅思考试？我这种情况要考哪种雅思？UKVI雅思是不是比普通雅思简单？雅思一年考几次？什么时间考试？...今天，小申菌就来解答大家的疑问。带上小本子，认真做好笔记哦！一、雅思考试类型雅思考试分成三大类：普通雅思考试用于英国签证及移民的雅思考试（UKVI）和雅思生活及技...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >

2022
01-03

技能篇 | 新版PubMed使用教程

一、Pubmed 更 新PubMed已经更新一段时间了，今天带大家重新了解下操作技巧。01 广撒网，多捞鱼在科研课题决定之初，利用Pubmed进行充分的文献调研早已是一件家常便饭的事情，然而让人头疼是，在搜索关键词后，跳出的结果大多不是自己想要的剧情，很多与关键词不匹配的文章充斥其中，无疑加大了研究者文献筛选的工作量。 举个栗子，打开Pubmed网页之后，在检索框中，输入...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >

2022
01-01

一文初识NCBI数据库（一）

NCBI (National Center for Biotechnology Information), 美国国家生物技术信息中心俗话说，民以食为天，而科研则以数据为天。NCBI包含的各类数据库无疑是科研数据积累的宝藏。今天，小编就用一文带你初步认识NCBI数据库。官方网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/NCBI 开发有 Genba...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >

2021
12-22

PBS 作业管理系统使用总结

前面我们所给出的各个例程一般都是在单台计算机上直接使用 mpiexec 或 mpirun 执行的，但是在实际应用中，对规模比较大的高性能计算任务，一般会提交到集群或超级计算机平台上进行计算。集群系统具有低成本、高性能的特性，提供了强大的批处理和并行计算能力，代表了高性能计算机发展的新方向。在集群或者超级计算机平台上，一般不能随意地直接以 mpiexec 或 mpirun 运行我们的并行计...阅读... 阅 读 全 部 >

2021
12-01

最新HGVS基因突变命名规则速览

导读：随着二代测序技术临床应用的不断增加，越来越多与癌症发生发展密切相关的突变被鉴定出来。将基因突变的结果更好地转化为实际临床应用，统一而通用的突变命名规则就显得尤为重要。人类基因组变异协会（HGVS：Human Genome Variation Society）规则是目前学术界所公认的命名规则。从不同的维度出发，相同的基因突变可以有多种不同的表现形式，例如，参考序列的不同、表...阅读全文>... 阅 读 全 部 >

2021
11-29

人类基因组变异学会（HGVS）基因突变命名规则

人类基因组突变学会（Human Genome Variation Society，HGVS）已建立系统的基因突变命名方法，是目前学术界所公认的命名规则。具体基因突变命名方法可查阅网站http://www.HGVS.org/varnomen。HGVS基因突变命名指南根据需求不断更新。HGVS官方网站遗传信息的流动遵循中心法则，即从DNA传递给转录后的RNA，后者进一步修饰后再翻译...阅读全文>... 阅 读 全 部 >

2021
11-28

扫盲贴：基因上的这些符号究竟是什么鬼？ 基因究竟是如何命名的？

转载请注明：解螺旋·临床医生科研成长平台关于基因，它早期的名称可以说是毫无章法，命名全凭研究者的个人喜好以及天马行空的想象力，比如果蝇里的吸血鬼基因（dracula，怕光）、蓝精灵基因（Smurf，调控SMAD）、冰山美人基因（Icebox，突变后对异性示好无感）、都铎王朝基因（tudor，无后）等等。显然，这种杂乱的命名方式，总会让科研者与基因面对面时感到一脸懵逼且无所适从，尤其不利于科研者对基... 阅 读 全 部 >

2021
11-13

手把手学习TCGA数据库：SNP突变分析第二期

各位芝士的朋友好，今天我们继续聊我们的SNP话题，前面两讲我们分享了SNP发生的位置，发生的类型以及SNP的命名，并且特意提到了SNP的两个数据库，今天我们来学习一下这两个数据库的使用。dbSNPdbSNP 全称为The Single Nucleotide Polymorphism Database，即单核苷酸多态性数据库，意思是“DNA序列中的单一碱基对（base p...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >

2021
11-09

“浅尝”全转录组研究套路！

最近越来越多的科研君紧跟“步伐”，“玩转”起了全转录组（全转录组即包含mRNA，small RNA，lncRNA，circRNA的测序）。全转录组之所以这么火的原因就在于大家逐渐意识到单一的mRNA或ncRNA研究已无法满足科研需求，需要结合多种RNA信息进行整合分析，探索潜在的调控网络机制。而全转录组测序无疑成为阐释生物学问题的利器！但是目前存在的一个问题可能很多老师对全转录数据如何进行深度..... 阅 读 全 部 >

2021
11-06

可变剪接及其表观遗传调控（万字长文总结）

本文根据 2016 年 8 月复旦大学倪挺教授在「表观基因组学暑期国际讲习班」中的报告整理而成，本文采用第一人称叙述，文中的“我”皆指倪挺教授。报告原视频详见： 表观遗传系列视频13 | 复旦倪挺：表观遗传调控与基因剪接（附PPT） ，视频全长约 2h34min，文字约 1.6 万字。虽然是四年前的视频，但内容依然不过时，可帮助我们快速建立对转录水平表观调控的认识。 倪挺博士，复旦大学...阅读全... 阅 读 全 部 >