2021 09-12 R基础|R的6种对象 前文我们讲到R处理数据面对的6种对象:向量,矩阵,数组,因子,列表,数据框。A. 那我们就得好好给大家介绍一下这位能者的6个对象都长什么样子了。· 1.向量 ·向量大体上分为3种,数值向量,字符向量,逻辑向量。(单个向量内元素类型必须一致)数值向量:> c(1,2,3,4,5,6,7)[1] 1 2 3 4 5 6 7字符向量(字符向量使用单...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2021 08-26 转录组测序——RPKM、FPKM、TPM 在转录组测序(RNA-Seq)中,对基因或转录本的read counts数目进行标准化(normalization)是一个极其重要的步骤,因为落在一个基因区域内的read counts数目取决于基因长度和测序深度。基因长度的影响:在同一个样本中,基因越长,随机打断得到的片段就越多,该基因被测到的概率就越大,比对到该基因的reads就越多。测序深度的影响:不同样本中,样本的测序深度越高...阅读全文... 阅 读 全 部 >
2021 08-25 寻找耐药菌的踪迹,CARD数据库在线使用教程来袭 随着抗生素药物的发现及使用,产生了越来越多的耐药菌株。耐药性会增加疾病治疗的难度和成本,因此耐药微生物的研究显得尤为重要。细菌的多种耐药机制由大量耐药基因所编码。耐药菌在基因水平上的改变主要包括固有耐药性、获得耐药性以及多重耐药性。固有耐药性来源于细菌本身染色体上的耐药基因。获得耐药性则是由于敏感的细菌发生基因突变或获得外源性耐药基因所产生的。多重耐药性则是指细菌同时对多种不同作用机制,或结...... 阅 读 全 部 >
2021 08-24 NGS基础概念 来源自:华大科技知识库组学研究细胞、组织或是整个生物体内某种分子(DNA、RNA、蛋白质、代谢物或其他分子)的所有组成内容,称之为“组学”(-omics),”-omics”术语代表了对怎样思考生物学和生物体系工作方式的重新定位。组学研究包括对基因组及基因产物(转录子组和蛋白质组)的系统生物学研究,随后必然要上升到细胞机制、分子机制和系统生物学的水平。...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2021 08-22 生物信息分析入门全攻略 生物信息学是生命科学研究的重大前沿领域,未来将占据生命科学研究的半壁江山。已经有越来越多的小伙伴投入到生物信息的学习中,但是入门难、深入慢、摸不到方向等都成为持续学习的拦路虎。本文根据生物信息技术大牛成长经历和华大人才培养经验总结入门攻略,带领小伙伴们全面破解生物信息学习难题。谁可以来学什么是生物信息学?现在已有的定义都非常宽泛,例如这个:“生物信息学利用应用数学、信息学和计算机科...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2021 08-18 生信分析过程中这些常见文件的格式以及查看方式你都知道吗? 生信分析过程中,会与很多不同格式的文件打交道,除了原始测序数据 fastq 之外,还需要准备基因组文件 fasta 格式和基因注释文件 gtf 格式。在分析的过程中还会有众多中间文件的生成,如 bed 、 bed12 、 sam 、 bam 、 wig 、 bigwig 、 bedgraph 等,生成后我们一般会查看下内容了解文件每一列的含义,以此来决定需要提取哪些有用信息列来进行下...阅读全文... 阅 读 全 部 >
2021 07-01 非编码RNA类型及功能汇总 导语非编码RNA种类繁多,家族庞大,没一定的方法根本就记不住都有谁。麦子有一套记忆心得来帮助大家记住这些非编码RNA的种类和功能,免得老板问起来什么都不知道。非编码RNA由于功能强大,站上舞台摇曳生姿已久,前几日老谈问我:“非编码RNA除了热门的miRNA,lncRNA还有啥啊?”我本想不屑一顾,结果:“多呢,还有tRNA,rRNA, 什么什么RNA来着,反正那几个嘛!呀,我好忙呢!”额,只能一溜... 阅 读 全 部 >
2021 04-28 超详细Maven快速入门到精通 课程介绍 从小白到精通Maven课程,本套课程从项目为什么需要构建工具到项目仓库私服搭建,涵盖内容有Maven概述、Maven依赖管理、Maven生命周期管理、Maven常用命令、Maven整合Idea、nexus私服搭建等。是入门Maven小白必备课程,以浅显易懂的语言、深入浅出的讲解,带你走入Maven的世界,熟练Maven的使用,从入门到精通。 学习地址 百度:... 阅 读 全 部 >
2021 03-15 PPT数据分析报告实战课程 课程介绍 适合需提升竞争力、提升工作效率、喜欢用数据说话的职场人士,如从事产品、运营、市场、财务、人事、分析等。学数据分析--主要介绍数据分析报告分析思路构建、图表展现、结论撰写、PPT报告排版方面实战方法与技巧。 学习地址 百度:https://pan.baidu.com/s/1HFo0i4EilE32XV3OFkU7YA 天翼:https://cloud... 阅 读 全 部 >
2021 01-15 零基础玩转Linux+Ubuntu教程 教程介绍 本课程让Linux初学者快速学习使用Linux、熟悉Ubuntu环境,熟练学习各种格式的软件的安装、卸载;学习Linux的常用命令、在Linux下创建一个软件项目的方法;熟悉Linux下Samba、SSH、NFS等常用网络服务的配置和使用。 学习地址 百度:https://pan.baidu.com/s/1XG8tLAQbkBoAMm6KzHDyLg&nbs... 阅 读 全 部 >