2022 06-04 30天学会R DAY7:数据提取及删除 当我们只需要对数据集中的部分数据进行分析,就需要用的数据的提取,这是日常最常用的命令。开始之前,我们先读入elder1这个文件elder1<-read.csv("elder1.csv")dim(elder1) #显示几行几列[1] 5846 12 显示5846行,12列一、 数据提取1. 子集的提取(行的提取)数据集子集提...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022 02-06 如何提取gff文件中的基因注释信息 gff3格式注释文件是最常见的基因注释,(https://archive.broadinstitute.org/annotation/argo/help/gff3.html)简单来说,gff3是以tab分隔的文本文件,共有9列,对应信息如下:1、seqname The name of the sequence. Typically a chromosome or a contig. Argo ..... 阅 读 全 部 >
2021 10-08 R语言对象的操作总结 现在本文将4种对象的程序方法进行进一步总结和凝练。一、is和as系列函数is 和as系列函数涉及不同类型数据和对象的鉴定和转换。我们经常在R语言编程过程中需要了解某一种数据的类型,也可能进行转换方便计算,所以诸位要熟悉他们。is系列是判断某一个数据中的观察值是何种类型,或者数据属于何种对象与结构• is.character(x) #判断是否为字符型• is.numer...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2019 06-28 DNA提取过程中各种试剂的作用 EDTA螯合Mg2+、Ca2+等金属离子;抑制脱氧核糖核酸酶(DNase)对DNA的降解作用(DNase作用时需要一定的金属离子作辅基);EDTA的存在,有利于溶菌酶的作用,因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。SDSSDS是离子型表面活性剂;溶解细胞膜上的脂质与蛋白,因而溶解膜蛋白,从而破坏细胞膜;解聚细胞中的核蛋白;SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3-...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >