单细胞测序技术能够精确细分每个细胞独特的基因表达特征，深入研究细胞间的相互作用关系，在肿瘤免疫等方面成为人们越来越看重的技术，热度也是不断上涨。随着热度的增加，关于单细胞的文献数据也是爆炸性增长！大家在学习单细胞技术和写论文时，很多问题也是爆炸性增长！那么如何快速找到需要的单细胞数据？有哪些好用工具可以帮助我们完成日思夜想的论文？今天小编在这里挑选了一些好用且有特色的单细胞数据库分享给大家。1、P... 阅 读 全 部 >
大家好，我是二喵妈妈。我家小蓝于今年4月份诊断出湿性猫传腹，现已治愈3个多月。希望这篇文章能帮到大家～本文主要侧重于猫传腹的原理科普，如何诊断FIP以及如何预防猫传腹。特别是如何预防FIP这块，希望猫家长们都认真看看。不要给自己后悔的机会。先看目录：附：关于猫传腹的通俗解释一、猫冠状病毒（FCoV）是什么？二、FIP猫常见的外在症状与内在指标...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
人类基因组计划（Human Genome Project，HGP）的完成标志着科学家们已将人类的一个完整的遗传密码握在手中。而与这些密码相关的其他内容同时也在静静地参与导演着生命的全过程。于是，一场更加盛大的探究基因组中功能元件的活动拉开了帷幕， DNA 元件百科全书（the Encyclopedia of DNA Element，ENCODE）计划应运而生。ENCODE 项目的目标是建立人类..... 阅 读 全 部 >
荧光蛋白（fluorescent protein）属于一种可视化的报告基因编码蛋白，在一定的波长下可发出明亮荧光，它的特点有荧光稳定、容易检测、对细胞无毒害、无需底物和无物种特异性等。常见的有绿色荧光蛋白、红色荧光蛋白等。绿色荧光蛋白（GFP）简述及应用：绿色荧光蛋白（GFP）是一个由约238个氨基酸组成的具有潜力的标记物，分子量约27kDa。荧光基团能够自身催化组成生色团，通过紫外光或蓝光激..... 阅 读 全 部 >
一：GETPrime数据库我们经常为寻找基因和特定转录本的qPCR引物所犯难，不用怕，在GETPrimer你可以得到所有基因的引物，并且考虑了SNP等情况。直接可视化设计出来基因的位置。二 InterPro分析蛋白的相关结构域信息三 ReFOLD蛋白质3D模型的细化可以被认为是蛋白质结构预测的“终末游戏”。通常需要对预测模型进行微妙的改进，将它们移动到“最后一公...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
科研的基本研究便是基因的研究，拿到一个新基因，第一步要做的便是查阅文献、数据库，用一切方法来确定基因是否值得研究。下面我就介绍几个常用网站，以模式动物小鼠基因MMP2为例，对基因进行初步分析。一：基因基本信息1.首先通过biogps网站(http://biogps.org/#goto=welcome)看一下基因的组织表达。(1)输入基因名称，选择物种，这样就可以看到该基因在各个组织的表达...阅读... 阅 读 全 部 >
蛋白质是生命活动的体现者，其结构决定着功能。由线性氨基酸组成的蛋白质需要折叠成特定的空间结构才具有相应的生理活性和生物学功能。解析蛋白质的空间结构对于认识蛋白质的功能、功能的执行、生物大分子间的相互作用，以及医学和药学的发展（如药物靶点的设计等）具有重要意义。为了更快速地了解蛋白质功能，不能只等待蛋白质的测定结果，尤其是对未知蛋白质开展研究之前，通过对蛋白质结构进行预测具有明显的优势。理论基础蛋白... 阅 读 全 部 >
作者：卢平 编辑：Yuki 从数十亿年前的原始单细胞生物开始，地球生命的演化之路就充满着革新：细胞核形成——有性生殖发生——多细胞生命出现——组织分化——器官形成——由海生到陆生……在枝繁叶茂的生命之树上，无数新的功能和结构让众多物种能够适应不同的环境和资源，各居其位。而所有这些创新的根源，几乎都来自于每个细胞中的一套基因组中。 基因组本身是DNA分子长链，可比作一串ATCG四种碱基组合排列... 阅 读 全 部 >
作者简介野菜团子，R语言中文社区专栏作者 博客：https://ask.hellobi.com/blog/esperanca forcats包用于处理因子，可以更高效地对因子进行修改。1. 生成因子R语言的base包中函数如dataframe等默认因子在分类变量读入时就会生成，而tidyverse包中的readr等包则会保留数据读入时的原样不做改变，要生成因子则可以使用parse_factor函数... 阅 读 全 部 >
10X Genomics测得的单细胞数据是包含细胞及其表达量在内的高维数据，无论是PCA还是tSNE都是纯数学的数据降维方式，以此得到的细胞分群不具有生物学意义，故而我们通常需要赋予细胞分群以生物学含义即完成细胞亚群到细胞亚型的映射。在这一过程中，我们需要解决两个问题：（1）已知细胞亚型的鉴定，如外周血样品中鉴定红细胞、单核细胞等对应哪些细胞亚群；（2）未知细胞亚群或罕见细胞亚型的鉴定，如肝脏样品... 阅 读 全 部 >