关于预印本“bioRxiv”的一切：到底多少文章能发表，有多少新冠病毒文章？

2019年末的新冠大流行给全世界人民带来不可估量的损失，而就在新冠大流行中，越来越多的学者注意到预印本bioRxiv的高频出现。那么，bioRxiv到底是何方神圣？下面我们将就“bioRxiv”的前世今生以及它在新冠大流行过程中的作用给大家一一列举。

1991年，洛斯阿拉莫斯（Los Alamos，USA）国家实验室的物理学家创建了一个中央服务器，用于起草新的研究文章，它就是预印本平台的鼻祖，后作为arXiv在线重新发布，是最早最具代表性的预印本开放平台(https://arxiv.org/)。

2013年11月11日，美国冷泉港实验室（Cold Spring Harbor Laboratory, CSHL）启动了BioRxiv，旨在将BioRxiv打造为生物学家专有的预印本文献库，且预印本在线期刊是不需要经过同行评审的期刊（peer reviewed journal）。没有漫长的评审过程，使得论文在1-2天内就会在网站上刊登，且完全免费。“bioRxiv”甚至成了《科学》杂志2017年度十大“科技突破”新闻之一（https://www.biorxiv.org/）。最初的预印本文章主要集中在物理学和数学等理论科学领域，但生命科学预印本平台“bioRxiv”已经涉及到自然科学和社会科学的方方面面。

2016年1月，中国科学院科技论文预发布平台ChinaXiv.org”开始接受研究论文（http://chinaxiv.org/）。国内相关预印本平台众多，只列其一。

2019年6月25日，由美国冷泉港实验室、BMJ和耶鲁大学联合运营的免费的、非营利性服务平台MedRxiv正式上线（https://www.medrxiv.org/）。

那么，预印本既然这么“流行”，他的文章都去哪里了呢。

早在2019年，美国明尼苏达明尼苏达大学遗传学、细胞生物学与发展系的Richard J. Abdill与明尼苏达大学圣保罗分校生态、进化与行为系的Ran Blekhman就2018年前5年内的预印本文章的命运做过Meta-Research分析（文章起初发表到bioRxiv，后收录于elife）。

根据对bioRxiv前5年中发表的37,648份预印本的分析，仅2018年一年在bioRxiv上发布的文章就多于前4年的文章总数。神经科学增长最快（每月有超过100万次的下载量），生物信息、进化生物学、基因组学及微生物学也增长迅速，新作者数更是翻了20多倍（平均每月有超过2100份的文章被上传到服务器供大家审阅）。其中，至少42%的预印本最终发表在同行评议的期刊上（后续占比持续增加）。当然，并不是影响因子越高文章数就一定越少，且热度起到很重要的作用--预印本的下载次数和最终发表期刊的影响因子存在显著地正相关（https://doi.org/10.1101/515643 (2019)）。

最后，我们再来聊聊新冠大流行中呈井喷式增长的bioRxiv。

5月22日，来自德国Leibniz经济学信息中心、英国利物浦大学健康数据科学系、英国MRC分子细胞生物学实验室、美国ASAPbio、英国Biologists公司和英国Hughes Hall学院（通讯）联合发表预印本文章“Preprinting a pandemic: the role of preprints in the COVID-19 pandemic”/（ Short title: The role of preprints in the 2020 COVID-19 pandemic）系统的分析了发表到预印本bioRxiv（包括medRxiv）上文章对疾病流行及传统出版业带来的影响，侧面反应科研工作者对预印本bioRxiv的态度转变。

2020年1月至2020年4月，COVID-19已导致320万例确诊病例和220,000例死亡。尽管上一次病毒性呼吸道疾病大流行仅在十年前就席卷了全球，但科学的运作方式和对时事的反应在过渡时期经历了重大转变。

截至2020年1月（爆发前），在COVID-19爆发的头4个月中，bioRxiv和medRxiv张贴了2,527张预印本。相比之下，在暴发发生的各个时间段，只有78种寨卡病毒和10种西非埃博拉病毒预印本被张贴到bioRxiv和medRxiv上。COVID-19预印本的激增不能通过与流行病相关的比例增加而提高预印本服务器的使用率来解释，与新冠病毒大流行共存的预印本bioRxiv字样可以用刷屏来形容。

而后科学界反应更加强烈，在首例确诊病例后的4个月内共发布了16,000多篇与COVID-19相关的科学文章，其中至少有6,000篇由预印本服务器托管（在新冠大流行的早期就有bioRxiv文章发表，包括medRxiv）。

在公众参与度方面，访问和分发的COVID-19预印本比非COVID-19预印本至少多15倍，参考预印本甚至成了新闻业的主流做法。

我们还发现了预印和出版行为发生变化的证据：COVID-19预印本更短，面板和表格更少，并且审核速度更快。

我们的研究结果突显了预印本科学传播中的空前作用，以及流行病可能对科学出版业产生的长期影响。