分类目录归档：

2023
05-06

单细胞注释工具汇总

在单细胞研究中，最重要的一个环节就是细胞类型注释，这是一个极其考验研究者研究背景和精力的工作，但随着单细胞的研究越来越多，可提供给我们的细胞类型的marker信息也越来越丰富，基于这些marker信息开发的细胞注释算法使得我们的细胞注释工作越来越省力，今天就跟随小编的脚步来盘点一下最常用的细胞类型注释工具吧！SingleR：最早是来自一篇肺部巨噬细胞研究的单细胞论文，这篇文章作者用...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2023
04-22

免疫浸润分析方法总结

总结目前主流的免疫细胞浸润方法，整理归纳可用的资源及相关代码的实现，以及可视化方式，方便以后查询和分享。这里面提到的免疫浸润分析主要是基于组织样本转录组测序数据或者基因芯片数据的分析。因为我们取到的肿瘤组织并不只是包含肿瘤细胞，其中还有正常细胞、免疫细胞、基质细胞、血管细胞等。不同的细胞具有一些标志性的marker，免疫细胞也是一样。因此，可以根据这些marker基因在组织中的表达...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2022
06-03

30天学会R DAY5： R语言对象的操作总结

R语言主要分析的对象是数据集，R语言数据集主要是向量、矩阵、数据框、列表、数组等，我们主要介绍前4种。前面2文已经进行了4种对象的介绍，现在本文将4种对象的程序方法进行进一步总结和凝练。一、is和as系列函数is 和as系列函数涉及不同类型数据和对象的鉴定和转换。我们经常在R语言编程过程中需要了解某一种数据的类型，也可能进行转换方便计算，所以诸位要熟悉他们。is系列是判断某一个...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2022
06-03

玉米RNA-seq测序数据差异基因分析

huanying今天给大家分享一个非常棒的玉米转录组的流程分析。原文作者是cxge，首发于omicshare论坛，阅读原文可跳转至本文的帖子哦~软件及参考基因组BWA, Samtools, Hisat2, HTseq, gffcompare, Stringtie, Ballgown，RB73-V3, B73-V4(Enzampl database)流程protocol首先从原始...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2022
06-02

收藏| Primer-BLAST：NCBI的引物设计和特异性检验工具

一、Primer-BLAST 介绍Primer-BLAST，在线设计用于聚合酶链反应（PCR）的特异性寡核苷酸引物。Primer-Blast 可以直接从 Blast 主页（ http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/ ）找到， 或是直接用下面的链接进入：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/这个工具整合了目前流行的 P...... 阅 读 全 部 >
2022
02-07

值得收藏！VScode 中这 15 个神仙插件写代码必备！

Visual Studio Code 是一款轻量级但功能强大的源代码编辑器，适用于 Windows、macOS 和 Linux。内置了对 Java、Type 和 Node.js 的支持，并为其他语言（例如 C++、C#、Java、Python、PHP、Go）并且提供了丰富的扩展生态系统。今天我将给大家介绍 VsCode 常用操作及非常棒的插件， 喜欢本文记得收藏、点赞、关注...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >
2018
04-20

PC百度网盘分享链接密码查询工具

口子是百度网盘万能钥匙的：http://www.xiaodao.la/i-wz-44743216.html链接一定要输正确，不能有多余的后缀，否则查不到密码，建议还是下插件方便点PC百度网盘分享链接密码查询工具大小：10MB | 来源：https://pan.baidu.com/s/1nbypBIOrwjdcjNuD-37Hsw已经过安全软件检测无毒，请您放心下载。阅读全文>>... 阅 读 全 部 >