GPB | PIGOME：猪功能基因组多组学数据库
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福尔马林固定石蜡包埋（Formalin Fixed Paraffin Embedded，FFPE）样本是临床上长期保存病理样本的常用方法，其可以和有价值的临床数据（如患者临床资料，患者生存预后信息，用药和治疗疗效等）相关联，为确定疾病的发生发展机制研究、生物标志物和药物靶标提供了巨大的资源 ，是进行回顾性研究的不二之选。但这种FFPE处理方式会使组织中的核酸发生不同程度的降解，在过去由于技术...... 阅 读 全 部 >
这阶段是确证选定靶标的调控会引发预期的生物效应并与临床治疗相关。常用的方法有基因突变、基因敲除、使用抗体、药物抗性突变和siRNA等。值得关注的是，51%的临床二期的失败都是由于药效不够，很多都归因于前期靶标确证工作的不足。这一阶段的失败随之而来的是后期巨额投入的付之东流。疾病关联临床靶标确证平台（https://www.targetvalidation.org/）整合了...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
糖尿病是一种以血糖升高和代谢紊乱为主要特征的疾病，属中医学“消渴病”范畴。其中2型糖尿病占所有糖尿病患者的95%左右，严重威胁人类健康[1]。2型糖尿病又称为非胰岛素依赖型糖尿病，多发于肥胖及中老年人群，患者体内胰岛素分泌相对不足或作用效果不佳。2型糖尿病可诱发多种并发症，包括糖尿病心血管疾病、糖尿病肝病、糖尿病肾病等。临床上治疗2型糖尿病一般分为注射胰岛素和口服降糖药2种方案。然而，这2种方案的... 阅 读 全 部 >
在过去的20年中，生物学家和化学家一直致力于开发一种高效和先进的药物发现和评价系统［1］，不仅可以高效率地发现靶向治疗药物，而且可以降低潜在药物不良反应的发生风险。为了减少新药开发的时间并降低费用，科研人员将目光转向了基于计算机和大数据的方法，如虚拟筛选（VS）和分子对接，但这些方法具有准确性差和效率低等问题［2］。人工智能（AI），包括深度学习（DL）和机器学习（ML）算法，有望可以克服在药物设... 阅 读 全 部 >
DisGeNET数据库是一个与疾病相关的基因数据库，整合了来自各种存储库（包括孟德尔，复杂和环境疾病）的人类基因疾病协会（GDA）和变异疾病协会（VDA）的信息。具体技术包括对基因-疾病词汇的mapping、DisGeNET本体分析。网址：https://www.disgenet.org/目前的版本DisGeNET v4.0，包含17,381个基因，15,093 种疾病、异常和...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
第一步：获取歌曲ID打开网易云音乐，随意选择一首歌曲，在浏览器网址中或客户端分享歌曲链接中复制歌曲的ID。 例如，《我曾》这首歌的ID为1336856777。第二步：获取歌曲直链获取歌曲ID后，直接拼接获取歌曲的直链。 例如，《我曾》这首歌的直链为：[http://music.163.com/song/media/outer/url?id=13368...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
GenAlex是一款应用于EXCEL的生物数据分析工具插件，运行后可以在Windows的excel中使用，功能强大又好上手。它可以对共显性数据、单倍体数据和二元数据进行分析。GENALEX还提供了一系列基于频率的分析， 20多种不同的图表总结数据辅助检测。除此之外，序列信息和基因型数据可以方便地在相关软件中转化格式。操作步骤建立一个表格，第一行首先写上位点数，个体数，居群数，然后开始与第二行对应标... 阅 读 全 部 >
裸花紫珠Callicarpanudiflora Hook. et Arn为马鞭草科紫珠属植物，干燥叶入药，主产于海南、广东、广西等省份，是海南省道地药材和黎药大品种，为《中国药典》2020年版唯一新增收载药材，具有消炎、解肿毒、化湿浊、止血等功效[1]。课题组前期对海南岛裸花紫珠种质资源进行调查，发现生产上尚无优势品种，人工栽培种苗大部分来源于自留种，长期以来会导致种质混杂，药材产量与质量参差不齐... 阅 读 全 部 >
Structure是由斯坦福大学Pritchard实验室开发的一款群体结构分析软件。structure可通过贝叶斯聚类方法对每个样本的来源进行判断，进而反应群体的遗传结构。真正跑时burnin设为100000，跑100000代，k设为1-20，每轮运行10次。序列文件用xmfa2struct转为structure可识别的格式，SSR用Genalex转为structure可识别的格式。操作步骤打开s... 阅 读 全 部 >
GENEPOP是一个非常实用的群体遗传学分析软件 ,适用于对大量的群体遗传学数据进行分析。下面我们就来介绍一下它的使用方法。操作步骤先用GenAlEx把数据转为Genepop格式格式转好了放到程序目录下，删除其他之前运行剩下的结果文件，仅保留三个文件运行软件，输入输入文件的名称确认信息，回车可以进行很多项分析一共有8个选项：1.Hardy-Weinberg test:进行种群内各位点的平衡状态及种... 阅 读 全 部 >
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