2023
04-16
04-16
分享8个非常实用但是名气不大的软件
分享8个非常实用但是名气不大的软件1、uToolsuTools是一个非常强大的生产力工具箱软件，它自由集成了丰富的插件，可以快速匹配场景功能，用完即走。uTools优秀的插件化设计，让你可以自取所需，任意组合。插件一般仅数百KB大小，简洁美观、没有广告，解决你问题的，一个插件即可。uTools作者将此软件设计为”一切皆插件“的插件化工具，所有的功能均可通过插件实...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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基因序列到进化树：轻松掌握多物种DNA序列比对与进化分析
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MEGA:多序列比对软件的下载与安装
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ESPript：轻松绘制多序列比对结果，打造出版级Figure！
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2023
04-16
04-16
值得推荐的13款电脑实用软件，第4款堪称全能王者
以下13款免费实用软件，全都是自用推荐，使用时长0.5-3年不等！第4款和第5款，简直不要太全能，一个抵千个！一、系统工具1、清理工具Glary Utilities一款简洁但强大的系统清理与优化工具，能够修复、增强、清理以及保护你的电脑。支持的功能有：一键清理电脑垃圾、注册表修复和清理、修复无效的快捷方式、重复/空文件查找、卸载电脑软件、进程管理、系统...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023
04-16
04-16
Admixture：一款快速分析群体遗传结构的软件
群体遗传结构(Structure)指遗传变异在物种或群体中的一种非随机分布。按照地理分布或其他标准可将一个群体分为若干亚群，处于同一亚群内的不同个体亲缘关系较高，而亚群与亚群之间则亲缘关系稍远。群体结构分析有助于理解进化过程，并且可以通过基因型和表型的关联研究确定个体所属的亚群。一般进行群体分析所使用的软件为STRUCTURE，但是STRUCTURE的运行速度较慢，如今Admixture凭借其高速... 阅 读 全 部 >
2023
04-16
04-16
百香果染色体水平的基因组可提供对香气生物合成的见解
中文名：百香果染色体水平的参考基因组装可提供对香气生物合成的见解英文名：Chromosome-level reference genome assembly provides insights into aroma biosynthesis in passion fruit (Passiflora edulis)杂志：Molecular Ecology Resources发表时间：2020年12月... 阅 读 全 部 >
作者：微生态编译：微科盟中元，编辑：微科盟茗溪、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载，转载须注明来源《微生态》公众号。导读人类肠道中有胆汁酸7α-去羟基细菌，通过bai操纵子编码的酶从宿主来源的胆汁酸中产生次级胆汁酸，如脱氧胆酸(DCA)。虽然最近的宏基因组研究表明，这些细菌是高度多样化和丰富的，但DCA生产者很少被确认。本文研究了20世纪80年代从人类粪便中分...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023
04-16
04-16
Nat Ecol Evol共同一作|鹦鹉螺基因组揭示针孔眼形成和生物矿化机制
近日，中国科学院南海海洋研究所喻子牛研究员团队鹦鹉螺基因组研究成果以“The genome ofNautilus pompiliusilluminates eye evolution and biomineralization”为题，在国际著名期刊Nature Ecology & Evolution（IF：12.544）上在线发表，百迈客生物科技作为共同一作共同参与研究。文中通过三代Pac... 阅 读 全 部 >
2023
04-16
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MER：解析麻蝇的适应性进化
前言2020 年 8 月 27 日，欧易生物与中南大学基础医学院法医系主任郭亚东课题组合作项目，以题为“Chromosome‐level de novo genome assembly of Sarcophaga peregrina provides insights into the evolutionary adaptation of flesh flies”发表在 Molecu...阅读全文... 阅 读 全 部 >
2023
04-15
04-15
密孔菌降解木材效应存在着保守的酶解反应机制
研究背景担子菌在木材分解方面具有重要的意义,大部分能够降解木材的物种都属于担子菌。白腐菌是属于担子菌亚门的真菌 ，因腐朽木材呈白色而得名。白腐菌是生物界中一类奇特的丝状真菌，是能够降解木材主要成分(纤维素、木质素和半纤维素)的微生物之一 ，它们对各种异生物质具有独特降解能力和降解机制。白腐菌对木质纤维素的降解很大程度上是一个复杂的酶学过程，需要一系列的水解和氧化酶的协同作用来完成，而且不同的白腐菌... 阅 读 全 部 >
2023
04-15
04-15
WGCNA中的eigengene有什么重要意义呢？
经过软阈值确定，TOM矩阵计算，层次聚类和动态切割后，我们获得了一些基因模块，每个模块里面都可以看成是有共同目的的团伙。为了方便后面纷至沓来的相关性分析，尤其是跟性状的联合分析，现在需要选取出每个模块中的代表人物。这个过程就是寻找每个模块的eigengene(读音: 爱根金)这样，模块信息就变成了，行是eigengene，列是样本的矩阵了，十分简化。...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023
04-15
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过气明星的自我修养NamiRNA
撰写：生信小师妹 来源：小张聊科研平台的“ i生信”公众号，微信公众号搜索“ i生信”即可关注/扫描关注见文末#生信分析# #生信发文# #miRNA#自从1993年发现第一个miRNA以来，miRNA相关文章已经发表了15W+，且研究思路主要是基于miRNA的经典机制（详见正文——大多数人看到的miRNA），以至于持续研究20多年后，miRNA已然成了过气明星。...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >