2022 07-09 长链非编码RNA研究进展周刊(15期) 您的小可爱上线啦!“长链非编码RNA研究进展周刊”的专题连载如期更新,小编今日为大家更新第15期lncRNA研究进展周刊,走过路过不容错过!公告通知非编码RNA(ncRNA)是一组缺乏蛋白编码的内源RNA,分为小RNA和长链非编码RNA(lncRNA)。之前的研究多关注蛋白编码基因,对ncRNA功能知之甚少,甚至称其为转录“噪音”。然而,近年来的研究发现,ncRNA在多个生物学过程中起着...阅读... 阅 读 全 部 >
2022 07-01 ceRNA介绍及分析研究策略 前言现在生物学研究中对RNA的研究与日俱增,siRNA,piRNA,miRNA, LncRNA一个个明星分子层出不穷。更有一些新的名词不断产生,如ceRNA。其实ceRNA的提出也有一段时间了,而且它并不是一种新的RNA分子,而是一种调控机制。在最近的研究中表明基因在转录调控中存在多种模式作用,microRNA作为其中一种重要的调控因子,是长短约22nt的短链RNA,能够通过抑制目...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2022 06-07 表观遗传,一场环境对基因的逆袭 转载请注明:解螺旋·临床医生科研成长平台10余年前,华盛顿大学的生物学教授Michael Skinner的团队做过一系列有意思的实验。2005年,他们将怀孕的女大鼠(F0)暴露于一种农业中常用的杀真菌剂,乙烯菌核利。接着在无杀菌剂的环境中将她们的后代拉扯大,一直养了4代,也就是养到了她们的玄孙(F4)。结果几乎所有玄孙子的精子数量、繁殖能力都有下降,并且出现了年龄相关的不育症。在所...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2022 06-07 当我们在讨论表观遗传的遗传时,我们究竟在讨论什么? 本文根据 2016 年 8 月清华大学颉伟研究员在复旦大学「表观基因组学暑期国际讲习班」中的报告整理而成,本文采用第一人称叙述,文中的“我”皆指颉伟研究员。报告原视频详见:系列视频5 | 清华颉伟:表观遗传的遗传与重编程,视频全长约 2h30min,文字约 2 万字(不含提问)。且听颉伟教授由浅入深,娓娓道来。本文正确打开方式:阅读 2 万字长文确实需要花点时间,不过本文语言通俗,逻辑严密...阅... 阅 读 全 部 >
2022 06-05 表观遗传你了解多少? 经典的遗传学(Genetics)无法解释同卵双胞胎为何长相并非一模一样,克隆三花猫为何毛色不一致,因为这些变化不是由核酸序列改变引起的,而是与我们今天要介绍的表观遗传有关。表观遗传(Epigenetics)是指,在核酸序列不发生改变的情况下,遗传物质出现了可遗传的变化,从而导致可遗传的表型改变。目前,表观遗传学已从一个少有人关注的领域变成如今的研究热点。表观遗传现象表观遗传的现象很多,已...阅读... 阅 读 全 部 >
2022 06-05 一文看懂表观遗传学 表观遗传学作为近10年来炙手可热的方向,其研究已经深入到各个学科和领域,促进了医学,动物学,植物学,生殖发育等学科的发展,在疾病机制,诊断治疗,动植物性状改良等方面均获得了令人瞩目的成就和显著的突破。虽然全世界表观遗传学研究的如火如荼。但是,很多实验室仍不清楚表观遗传学到底是神马东西?总是听到很多老师和我们咨询,希望自己的课题能向前沿的方向靠拢,但总感觉隔着一层纱,感觉有些“高大上”,虽然很多文章... 阅 读 全 部 >
2022 05-16 WGCNA脚本的调整 WGCNA分析,是加权基因共表达网络分析。在文献中,我们经常能够看到这样的WGCNA分析图。例如文献“Expression profiles of circRNAs and the potential diagnostic value of serum circMARK3 in human acute Stanford type A aortic dissection”中的Figur...阅读全文... 阅 读 全 部 >
2022 05-16 数据挖掘,我们有秘密武器(下) 我们上一期介绍了数据挖掘中的表达量挖掘法(回顾戳这里☞),相信大家都已经了解了四大利器的威力,那么今天我们就带大家接着了解一下功能挖掘法和寻找“明星”的数据挖掘方法吧。图1.转录组数据挖掘常用方法功能挖掘法虽然我们进行了表达量的挖掘,但是每个基因在生物过程中都具有它们独特的功能,仅关注表达量的信息,会让我们漏掉非常多的信息。因此我们不能局限于表达量挖掘,而忽略了基因的功能。数据的挖掘除了...阅读... 阅 读 全 部 >
2021 11-09 “浅尝”全转录组研究套路! 最近越来越多的科研君紧跟“步伐”,“玩转”起了全转录组(全转录组即包含mRNA,small RNA,lncRNA,circRNA的测序)。全转录组之所以这么火的原因就在于大家逐渐意识到单一的mRNA或ncRNA研究已无法满足科研需求,需要结合多种RNA信息进行整合分析,探索潜在的调控网络机制。而全转录组测序无疑成为阐释生物学问题的利器!但是目前存在的一个问题可能很多老师对全转录数据如何进行深度..... 阅 读 全 部 >
2021 11-05 原来转录过程这么不规矩!——可变剪接 ❝如大家所知,RNA是由DNA转录而来的。然而,作为一个转录本来源的DNA转录区域却不一定是由某个连续DNA片段提供的,其中甚至可能有间隔DNA转录区的交叉,不同区域不同顺序的转录产物共同组成一个转录本,极大增加了DNA产生RNA的复杂度。高通量测序和表达谱芯片可以检测这种非常有意义的转录本剪接,今天小编就带大家简单了解一下可变剪接。❞概述可变剪接是指从...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >