2025 07-27 二代变三代,文库构建变在哪? 上次小编给大家介绍了,大家看过之后是不是也有一种想发高分文章的冲动?古语云“九层之台,起于累土”,今天小编就给大家重点介绍一下好文章背后的故事------PacBio三代测序的文库制备。首先,我们来认识一下三代测序的文库结构,与二代测序线状的文库结构不同,三代测序的文库是“哑铃型”的环状结构,中间是插入片段,两端分别是茎环结构的接头(图1)。这种“哑铃型”文库是三代文库设计的最大亮点,环状的文..... 阅 读 全 部 >
2025 07-26 三代+二代全新宏基因组测序分析产品闪亮登场 转眼间,十月已经到来,十月是一个充满希望的时节,是一个硕果累累的季节。在这么美好的时节里小锐有很多新技术、好消息与大家分享,接下来先向大家隆重介绍三代+二代宏基因组测序分析产品。随着测序技术的不断更新,三代测序技术也越来越成熟,Nanopore测序读长更长,错误率更低,对生物信息相关领域的研究具有重大意义。近年来Nanopore测序的宏基因组高分文章已发表多篇,且已成功应用于微生物宏基因组研究领域... 阅 读 全 部 >
2025 07-25 【Nature综述】NGS的这10年 随 着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以获得更多的数据量。与之对应的是,还有一些技术的进步使得单条序列的测序读长变得更长——...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
2025 07-24 Pacbio全长微生物多样性测序原理及实测结果展示 近年来,微生物群落结构多样性一直是科研工作者研究的热点,微生物“个 头小,本领强”,从人体的皮肤、口腔、胸腔、阴道到肠道、粪便,无处不在,又称为“人体第二基因组”,在人体中发挥着巨大的作用。还广泛存在于土壤、水体、发酵液、植物、空气等环境样本中,它们推动着地球物质循环,影响着人体乃至整个地球生物圈的健康。 传统研究中,是将环境样本中的微生物进行分离培养,提取已经分离培养出来的每一个纯菌的DNA,针... 阅 读 全 部 >
2025 07-24 单分子长读长测序助力比较玉米与其野生近缘种的转录组变异 期刊:Molecular Ecology Resources影响因子:7.093文章题目:Single-molecule long-read sequencing reveals extensive genomic and transcriptomic variation between maize and its wild relative teosinte (Zea mays ssp....阅... 阅 读 全 部 >
2025 07-22 全长转录组测序常见问题解答 1.PacBio测序平台的技术原理?利用 PacBio RS II/Sequel 进行全长转录组测序,平台包含 16 个测序模块(SMRT cell),每个 SMRT cell 包含 15 万/100万个测序单元(零模波导孔,ZMWs)。需要将 mRNA 进行反转录并进行环化处理,形成 CCS,每个 ZMW(零模波导孔)将容纳 1 个 CCS 分子。由于全长转录组测序对 mRNA ...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2025 07-19 利用全长转录组多重阵列测序检测同源异构体 哈佛大学和麻省理工学院近期发表了“High-throughput RNA isoform sequencing using programmable cDNA concatenation.”研究论文中,将 cDNA 串联成可用于长读长测序最佳的单分子的技术应用于肿瘤浸润 T 细胞的单细胞 RNA 测序,提高了寻找可变剪接基因的准确度,验证了 T 细胞中典型的 PTPRC 剪接模式...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
2025 07-16 单细胞转录组测序:从短读长到长读长的跨越 一、引言细胞作为生命的基本单位,承载着遗传信息并执行着复杂多样的生物学功能。然而,细胞之间存在着显著的异质性,这种异质性不仅体现在细胞类型和状态上,还体现在基因表达模式和分子调控机制中。传统的基因表达分析方法,如基于群体细胞的RNA测序(bulkRNA-Seq),虽然能够提供整体的转录组信息,但却掩盖了单个细胞之间的差异。这种“平均化”的数据使得我们难以深入了解细胞间的复杂相互作用以及细...阅读... 阅 读 全 部 >
2025 07-16 华西医院谢丹/廖皓天团队:体细胞结构变异在肝细胞癌发生早期的贡献——纳米孔长读长测序来揭示! 四川大学华西医院组学技术与生物信息研究室谢丹研究员团队联合肝脏外科廖皓天副研究员于2025年4月在GenomeResearch 发表文章“Multisite long-read sequencing reveals the early contributions of somatic structural variations to HBV-related hepatocellular c...阅... 阅 读 全 部 >
2025 07-15 高精度、低成本、长读长测序离我们还有多远? 在当今的生命科学和临床等领域,基因测序技术扮演着越来越关键的角色。经过近50年的技术探索,测序技术已从最初的Sanger法,发展到NGS,再到SMRT和纳米孔等单分子长读长测序技术。相较于NGS等短读长测序技术,长读长测序技术因其能提供平均读长超过前者两个数量级以上的序列,为科学研究和临床应用提供更强大工具,极大地拓展了测序所能覆盖基因组范围以及能解读变异类型的范围,重新定义基因测序的可能性。因此... 阅 读 全 部 >