2022 06-30 如何一秒获取Science、Nature等高分期刊配色? 相信各位在肝图表写论文时,一定都会思考:这张图表用啥颜色?论文整体配色搭配怎么把控才好看?毕竟高分期刊大牛文章的共通点,除了论文精彩,整体配色也十分具有吸引力。许多在线配色/提取颜色的工具效果不错,通过下载大牛文章使用PS、AI等直接“偷色”也不是难事。如今即便自己缺少美学灵感,但仍可以做到轻松获取出彩的配色方案。有兴趣可参考往期推文: 《作图颜色调得好,高分文章跑不了!》 、 《如何“偷走”..... 阅 读 全 部 >
2022 06-30 高分文章中物种与代谢物相关性热图是怎么画的? 测序行业的蓬勃发展,带来微生物组学日新月异的变化。目前,单一组学的文章不断“贬值”,前沿研究的目光从单一组学逐步拓展至多组学对贯穿分析,即结合多个组学的分析角度,从多个层面阐述生物学机制。微生物多组学贯穿分析策略十分丰富:如常见的16s与宏基因组贯穿分析,可以验证物种的特征、丰富功能的探究;而16s与代谢组的贯穿分析思路同样常见于高分文章中,通过16s探究不同处理/环境下菌群的物种组成变化,结合代... 阅 读 全 部 >
2022 06-30 R语言corrplot包相关性绘图代码...... 说到相关分析,我们都知道是用来观察变量之间相关性的一种分析方法,而得出的结果很难用表格形象展示,这个时候我们的相关性图形就派上了用场,那么接下来为大家介绍R语言情景下用mtcars数据集和corrplot包绘制相关性图形的方法:mtcars数据展示mtcars数据说明:数据的第一列为各种汽车型号,后续数据为汽车的多个性能参数。在相关性计算函数cor()中有三种算法来计算相...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
2022 06-30 R预设配色系统及自定义色板 作者:杜雨,EasyCharts团队成员,R语言中文社区专栏作者,兴趣方向为:Excel商务图表,R语言数据可视化,地理信息数据可视化。个人公众号:数据小魔方(微信ID:datamofang) ,“数据小魔方”创始人。关于配色的话题,已经聊过很多次了,但是就像是之前说过的,对于图形可视化而言,配色决定着作品的“颜值”,谈再多次都不嫌多。今天是R语言配色系统综合篇的上篇(当然是有下篇啦,下...阅读... 阅 读 全 部 >
2022 06-30 R语言“小提琴形图”的绘制 最初小编是在“A genome-based model for adjusting radiotherapy dose (GARD): a retrospective, cohort-based study”这篇文章中看到的一个图。它形似一张提琴图,展示了来自不同类型疾病患者个体的GARD得分的分布,图中红色点代表了中位数。但与常规提琴图不同的地方在于,提琴图中还添加了密度信息,即...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2022 06-30 5个画热图的R包,你都知道吗? 之前我们分享过R语言绘制热图(),用的是pheatmap包。其实画热图还可以用heatmap函数、ggplot2包、gplot包、lattice包来画,惊呆了吧~~今天我们就分别来说说这5个R包画热图的方法。先从heatmap函数说起。一、heatmap函数heatmap(temp,col=colorRampPalette(c("green","black","red"))(12),C...阅读全... 阅 读 全 部 >
2022 06-29 还在头疼如何给SCI论文配图?ggpubr帮你轻松搞定~ R语言中可视化包ggplot2可以绘制出优美的可视化图片,但如果要通过ggplot2个性化的绘制一套图形,尤其是适用于杂志期刊等出版物的图形,对于那些没有深入了解ggplot2的科研人员来说就有点困难了,基于ggplot2创建的可视化包ggpubr,用于绘制符合出版物要求的图形。作图方便简单,成图导出就可以用到文章中。01安装扩展包方法一、install.packages("...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2022 06-29 R语言-相关矩阵可视化包ggcorrplot 作者简介taoyan:伪码农,R语言爱好者,爱开源。个人博客: https://ytlogos.github.io/基于ggplot2包以及corrplot包的相关矩阵可视化包ggcorrplot,ggcorrplot包提供对相关矩阵重排序以及在相关图中展示显著性水平的方法,同时也能计算相关性p-value安装方法就不提了,不懂的可以浏览我以前的文章(可戳链接)library(ggcorrplot... 阅 读 全 部 >
2022 06-29 承包单细胞所有美图?这个R包就够了! 承包你单细胞的所有美图_Scillus包Hi,大家好,我是晨曦今天这期推文来自一个小伙伴的留言A同学:曦曦,除了ggplot2以外有没有更方便的方法可以更加丰富的展示我的scRNA-seq的结果,就是类似于scRNA-seq的ggpubr包 晨曦:有的,马上就来~ 基于上面这个感兴趣的话题,我们就来看一下这个单细胞测序可视化的R包——Scillus包,可以承包你关于单细胞的所有美图哦~那么我们开始... 阅 读 全 部 >
2022 06-29 高逼格生信绘图神器 —ClueGO GO和KEGG分析是最常用的生信分析方法,在SCI论文中也经常见到,那么你能想到的GO和KEGG分析结果的展示方法有哪些呢?条形图:饼状图:表格:相比于上面这些,这样的网络图展示起来是不是立马提升了几个档次:首先讲一下如何获取这一利器,ClueGO和CluePedia是Cytoscape的APP,点开Cytoscape的Apps菜单,找到这两个APP把它们下载安装了。然后你就能在A...阅读全文&... 阅 读 全 部 >